1、PLUMED安装包(根据你所用的MD engine,PLUMED有的版本不能patch你所用的MD engine。比如!PLUMED2.6.0是最新版,但是不支持Lammps。PLUMED2.4.7反而可以!!具体的去PLUMED官网看看); 2、BLAS和LAPACK库,直接去百度下载吧,我下面也会放链接。 3、已安装好的LAMMPS。 下载路径: PLUMED资源包 How to get PLUMED...
方法/步骤 1 在电脑上安装Plumed，这里要注意的是，plumed使用的编译工具要和Lammps使用的编译工具相同，作者使用的是mpich3. 将plumed可执行程序所在的文件夹加入系统PATH路径，以便后续步骤顺利进行。2 在Lammps的根目录下，本例中也就是lammps-11Aug17文件夹下，执行plumed-patch -p就会进入选择，选择6）Lammps。...
Redhat中BLAS包的安装 CBLAS编译安装与使用举例_Linux编程_Linux公社-Linux系统门户网站www.linuxidc.com/Linux/2015-02/113169.htm 运行"plumed patch -p"时出现了一些问题: plumed: error while loading shared libraries:libplumedKernel.so: cannot open shared object file: No such file or directory 找到...
现在想通过plumed patch -p 进行匹配，可是总是提示PLUMED location: /home/wf/plumed-2.0.1/lib/...
在QE目录下运行plumed patch -p，选择espresso，再编译QE失败。各位有用过plumed的么，patch到MD软件的...
plumed patch : patch an MD engine plumed vim2html : convert plumed input file to colored html usingvimsyntax plumed selector : create lists of serial atom numbers plumed config : inquire plumed about how it was configure plumed newcv : create a new collective variable from a template ...
2021版大幅 ...难怪colvars只提供GROMACS 2021.5-colvars和GROMACS 2020.7-colvars两个patch的版本 ...
sum the hills with plumed plumed patch : patch an MD engine plumed vim2html : convert plumed input file to colored html using vim syntax plumed selector : create lists of serial atom numbers plumed config : inquire plumed about how it was configure plumed newcv : create a new collective ...
gmx安装进行了plumed patch -p 输入 gmx_mpi mdrun -plumed 显示正常（我认为，截图如图一）但是在...
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