2.负荷图(Loading Plot): 负荷图展示了原始变量(如代谢物、基因表达等)对PLS-DA成分的贡献。每个点代表一个变量,其位置表示该变量在区分不同组别中的重要性。靠近图中心的变量对区分类别的贡献较小,而远离中心的变量则更为重要 3.VIP分数图(VIP Scores Plot): ...
1.得分图（Score Plot）：得分图通常用于展示样本在PLS-DA模型中的分布。每个点代表一个样本，不同的颜色或形状可以代表不同的类别。通过观察点的分布，可以了解不同类别之间是否有明显的区分。如果不同类别的点在图中清晰分离，则说明模型在这些类别上有良好的区分能力。2.负荷图（Loading Plot）：负荷...
(左下)离群点展示:由scoreMN以及loadingMN计算得出各样本在投影平面以及正交平面的坐标,并标注差异较大的样本。 (右下)得分图:各样本在PLS-DA轴中的坐标。 loading.pdf:根据载荷值的前两个主成分p1 p2绘制的载荷图,并标注各个成分的解释率 。 score_plot.pdf:由scoreMN绘制的得分图。 上传文件后,只需要一个...
# 每一列代表一位患者的多个数据,不同颜色代表了不同的分组(当然目前我们进行整理,如果您那边需要我把一个组的患者放在一起的话 # ,我这边再整理一下),我是想通过PLS-DA挖掘下不同组别患者间存在差异的指标有 哪些 library(mixOmics) ## Loading required package: MASS ## Loading required package: lattice...
From the plot, it was evident that the scores of LV1 played a significant role in separating the classes. Immature durian pulp had low values of LV1, as observed on the left side of the scatter plot, while moderately mature and mature samples showed some overlap on the right side of the...