比如常见的PCA、NMDS、PCoA及一些聚类算法(如k-means聚类),这些都是无监督模型。 02 有监督模型之判别分析Discriminant Analysis(DA) 有监督模型判别分析常见几类:线性判别分析(LDA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)。 说到判别分析,我们不得不提一下在微生物中常用的LEfSe...
PLS-DA采用了经典的偏最小二乘回归模型,其响应变量是一组反应统计单元间类别关系的分类信息,是一种有监督的判别分析方法。因无监督的分析方法(PCA)对所有样本不加以区分,即每个样本对模型有着同样的贡献,因此,当样本的组间差异较大,而组内差异较小时,无监督分析方法可以明显区分组间差异;而当样本的组间差异不明...