已经有很多推文基于ggplot2去可视化及美化点图: 比如咱们生信菜鸟团的Dotplot美化——使用ggplot2基于结果美化 生信益站的Seurat::DotPlot美化 (二) ——细胞亚群坐标轴Color Bar注释 那这边小谢就偷个懒,基于前辈们整理好的代码来使用ggplot2绘制marker基因的点图。 1. 提取数据并整理细胞亚群排序 #获
降低GGPlot 的利润率,与 plot.margin 存在问题。 首先,GGPlot 是一个用于数据可视化的开源软件包,它基于图形语法构建图形,提供了丰富的绘图功能和灵活的定制选项。GGPlot...
首先是示例数据 image.png 使用R语言的ggplot2做一个热图 #install.packages("see") df<-read.csv("20210809_example.csv") library...,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fil...
ggplot(df_linear_associations, aes(x = beta, y = name)) +geom_effect(filled = filled,size = size,position = position) +scale_colour_nejm() +labs(title = "Example of ggforestplot::geom_effect function",subtitle = "processed charts with geom_effect()",caption = "Visualization by DataCha...
ggplot2 作图 library(ggplot2) library(stringr) library(ggprism) x_level<-paste(df$Group1,df$Group2,sep="_") x_level df1$group<-str_sub(df1$new_col,5,7) df1$new_col<-factor(df1$new_col, levels = x_level) ggplot(df1,aes(x=new_col,y=value))+ ...
(ggplot(data = mydata, aes_string(x = x, y = y, colour = "color")) + geom_point() + scale_color_identity() + theme(plot.margin = unit(c(0, 0, 0, 0), "cm"))) } another.plot <- function(data, x, y) { data$decades <- round_any(as.integer(unlist(data[y])), 10...
plot <- (ggplot(data = mydata, aes_string(x = x, y = y, colour = "color")) + geom_point() + scale_color_identity() + theme(plot.margin = unit(c(0, 0, 0, 0), "cm")))}another.plot <- function(data, x, y) { data$decades <- round_any(as.integer(unlist(data[y...
# 引用形式的描述信息library(ggplot2)# 引入ggplot2包data<-data.frame(x=1:10,y=1:10)# 创建一个数据框plot<-ggplot(data,aes(x=x,y=y))+geom_point()# 创建一个plot图plot# 显示plot图plot+theme(axis.text.x=element_text(margin=margin(t=10)))# 调节x轴的间距plot+theme(axis.text.y=elem...
= .25, # We set the box size to better visualize the type line.margin = .1, # We n...
四、DotPlot联合ggplot2美化 # 在绘图过程中我们也可能遇到几十个基因同时绘制的情况,这时候避免出现字符重叠的情况,我们可以利用Seurat自带修饰主题或者ggplot2这个好帮手 # (1)Seurat自带修饰主题,调整坐标轴字符倾斜角度 DotPlot(sce_final, features = marker) + RotatedAxis() ...