`plot_cell_trajectory`是一个用于绘制细胞轨迹图的函数,可以展示细胞发育或转化过程中的状态变化。通过合理设置参数,可以根据不同需求来自定义绘制出符合分析目的的细胞轨迹图。 2. 参数列表 `plot_cell_trajectory`函数包含以下参数: -`data`:表示数据集的变量,包含细胞的状态信息。 -`x`:表示绘制细胞轨迹图的x...
1. 从trajectory图中提取数据 p2$layers[[1]]$data > p2<-plot_cell_trajectory(object_used_monocle2.cds,cell_size=1,color_by="seurat_clusters",show_tree=T)>p2 '#示例一 > head(p2$layers[[1]]$data) source target source_prin_graph_dim_1 source_prin_graph_dim_2 target_prin_graph_dim_...
com2 = self.file2["features"][str(p[0])]["com"][:]#write the cell label as textmlab.text3d(com1[2]-bbox[2]+1,com1[1]-bbox[1]+1,com1[0]-bbox[0]+1, str(number), color=(1,1,1), figure=figure)#plot a point where the current cell ismlab.points3d([com1[2]-bbox...
如果crontab设定任务每分钟执行一次，但执行的任务需要花费5分钟，这时系统会再执行导致两个相同的任务在...
SigmaPlot12用户指南教学课件资料.pdf,SigmaPlot12 用户指南 内容 1 SigmaPlot12.0 .1 1.1 What’sNewinSigmaPlot .1 1.2 InstallingSigmaPlot .2 1.2.1 SystemRequirements .2 1.2.2 SerialNumbers 3 1.2.3 AboutSigmaPlot ’sUserandProgramFiles3 1.3 SigmaPlotBasics .4
示例8: stacked_trajectory_plot ▲点赞 1▼ defstacked_trajectory_plot(xlabel="generation"):mpl.rcParams['font.size']=18haplotypes = get_all_haplotypes() trajectories = [get_trajectory(haplotype)forhaplotypeinhaplotypes] plt.stackplot(range(generations), trajectories, colors=colors_lighter) ...