phonopy --fc vasprun.xml phonopy --dim='5 5 1' -c POSCAR-unitcell band.conf phonopy-bandplot --gnuplot>551.dat 就可以获得二阶力常数矩阵 FORCE_CONSTANTS 和声子谱的数据 551.dat . ⑤如果是使用有限位移法,从④直接接到这一步。 这里需要准备和 POSCAR-00* 数目一样的文件夹,并把 POSCAR-00*...
2.phonopy前处理,利用phonopy扩胞 通过命令phonopy -d --dim a b c将POSCAR沿着a、b、c轴分别扩a、b、c倍; 通过命令phonopy -d --dim a b c --pa auto -c POSCAR-unitcell将POSCAR-unitcell沿着a、b、c轴分别扩a、b、c倍。 3.选择有限位移法或者微扰密度泛函方法(DFPT) 对于有限位移法 需要将POSCAR...
步骤二:将优化后的POSCAR保存到另一个文本中例如命名为poscar-111或者poscar-unit,方便之后使用;接着利用phonopy构造超包 phonopy -d --dim="4 4 1" dim里面的三个数字就是指在三个基矢方向上重复几次,我这里由于是2维材料,POSCAR中设置了真空层,所以第三个基矢方向只用重复1次。使用此命令后会得到一系列文件...
首先需要将待计算的结构进行优化（优化方法及参数设置参考前面的教程）。新建名为TS_thermal的文件夹，将优化好的结构文件拷贝至TS_thermal的文件夹中，执行‘cp CONTCAR POSCAR’。创建超胞。命令为：phonopy -d –dim = ‘m n l’生成一个SPOSCAR文件，其中包含的结构为由指定单胞扩展得到的m×n×l的超原胞...
在计算声子谱和二阶力常数矩阵时，首先需要准备的软件包括VASP（Vienna Ab initio Simulation Package）和Phonopy。为开始，需准备高精度优化后的结构文件（POSCAR）和电荷文件（POTCAR）。接着，使用命令“phonopy -d --dim='5 5 1'”将结构扩胞成5*5*1的超胞。扩胞后，会生成一系列文件，包括不...
1.cp CONTCAR POSCAR 2.phonopy -d --dim="1 1 1"3.cp SPOSCAR POSCAR然后进行一次vasp静态计算...
所有00*文件夹下的静态计算都结束后,在phono文件夹下,使用phonopy计算力常数(FORCE_CONSTANTS) phonopy -f 001/vasprun.xml 002/vasprun.xml 使用vaspkit生成KPATH.phonopy (echo 305 | vaspkit),作为band.conf文件,用phonopy画出声子能带图band.pdf phonopy --dim='2 2 2' -c POSCAR -p -s band.conf版权...
如附图，为啥计算声子谱就不行 ，提示：(base) [wmg@localhost Pt4Ti03]$ phonopy -d --dim="...
Phonopy 是一个开源工具，专用于声子计算，支持谐波和准谐波分析。以下是其关键功能的概述：1. 安装Phonopy后，通过命令行输入可以验证其安装状态，用于处理特定材料，如mp-460，这是一种具有立方[公式]空间群结构的[公式]化合物。2. 扩展单元格的处理涉及定义原子移动的幅度，例如，通过`--dim="2 2 ...
phonopy -d –dim = ‘m n l’ 生成一个SPOSCAR文件,其中包含的结构为由指定单胞扩展得到的m×n×l的超原胞,disp.yaml,和POSCAR-{number}(number= 001, 002 ... 6* 超胞内原子数),POSCAR-{number} 对应各个原子稍微偏离平衡位置的结构,对应所有振动模式。 在VASP中,直接采用POSCAR-{number}作为POSCAR...