这个命令会从bioconda这个conda频道安装perl-bioperl包。 执行命令并等待安装完成: 执行上述命令后,conda会自动解析依赖并开始下载和安装bioperl及其依赖项。 安装过程可能需要一些时间,具体取决于你的网络连接速度和conda服务器上的负载情况。 验证安装成功: 安装完成后,你可以通过运行一个简单的Perl脚本来验证bioperl...
失败尝试一:使用cpanm 有两个方法,一是直接用conda,简单。 conda install-c conda-forge perl-app-cpanminus 二是用系统自带的perl安装和配置local::lib和cpanm。这个详见徐州更的博文:如何安装perl模块 # 安装local::lib wget https://cpan.metacpan.org/authors/id/H/HA/HAARG/local-lib-2.000024.tar.gz tar...
查看conda安装bioperl后的存储的位置 conda list 查看miniconda3目录下,可以看到实际上我们已经安装上了Bio::Seq模块 bioperl模块的位置,不在 perl 的@INC里 把我们查到的模块路径选择一个安装到perl环境变量里面 export PERL5LIB=/home/data/t0202008/miniconda3/pkgs/perl-bioperl-1.6.924-4/lib/perl5/site...
首要步骤是检查conda安装bioperl后的实际存储位置。在miniconda3目录下，我发现Bio::Seq模块确实已经成功安装。然而，问题出在bioperl模块并未被正确地添加到perl的@INC路径中。@INC是Perl查找模块的默认搜索路径，如果没有将新安装的模块添加到这里，即使模块存在，也无法被Perl系统找到。解决这个问题的关键...
安装conda install -c bioconda perl-bioperl 安装完成如果不能正常调用bioperl出现Can‘t locate Bio/Perl.pmin @INC等报错,则需要配置一下@INC。 配置方法首先找到Perl.pm装在哪里 find ./ -name "Perl.pm" ./miniconda3/lib/perl5/site_perl/5.22.0/Bio/Perl.pm ...
有两个方法,一是直接用conda,简单。 conda install-cconda-forge perl-app-cpanminus 二是用系统自带的perl安装和配置local::lib和cpanm。这个详见徐州更的博文:如何安装perl模块 # 安装local::libwget https://cpan.metacpan.org/authors/id/H/HA/HAARG/local-lib-2.000024.tar.gz ...
有两个方法,一是直接用conda,简单。 conda install -c conda-forge perl-app-cpanminus 1. 二是用系统自带的perl安装和配置local::lib和cpanm。这个详见徐州更的博文:如何安装perl模块 # 安装local::lib wget https://cpan.metacpan.org/authors/id/H/HA/HAARG/local-lib-2.000024.tar.gz ...
有两个方法,一是直接用conda,简单。 conda install -c conda-forge perl-app-cpanminus 1. 二是用系统自带的perl安装和配置local::lib和cpanm。这个详见徐州更的博文:如何安装perl模块 # 安装local::lib wget https://cpan.metacpan.org/authors/id/H/HA/HAARG/local-lib-2.000024.tar.gz ...
BEGIN failed--compilation aborted at /home/data/gma29/project/02wy/iTAK/iTAK-1.4/iTAK.pl line 28. 会报一个找不到Bio/SeqIO的错误, 尝试在conda小环境里安装perl-bioperl, 但是没有解决. 然后用手动安装的方式想安装SeqIO这个模块, 安装成功了, 但是也还是运行不成功. ...
我第一次遇到这种情况的时候,在网上查了很多的教程,试过各种方法,以及重新安装相应的模块还是不能解决,在各种折磨之后终于找到了原因。 查看conda安装bioperl后的存储的...