在PDBx/mmCIF格式中,这些信息被存储在_atom_site类别中。下面显示的是条目4HHB的这一部分的前几行。 loop_ _atom_site.group_PDB # ATOM记录用于识别蛋白质或核酸原子,HETATM记录用于识别小分子的原子 _atom_site.id _atom_site.type_symbol # 原子类型 _atom_site.label_atom_id # 原子标签 _atom_site.l...
PDBx/mmCIF Syntax 原文链接:PDBx/mmCIF Syntax (wwpdb.org) mmCIF数据文件和字典中使用的语法来自STAR(Self-defining Text Archive and Retrieval)语法。在其最简单的形式中,mmCIF文件看起来像一个成对的数据项名称和值的集合。例如,在下面这个为单元格常数赋值的例子中,对语法的解释是直接的。
蛋白质结构数据库PDB中,mmCIF格式是___ crystallographic(晶体) information file 的简写。如何将EXCEL生成题库手机刷题 如何制作自己的在线小题库 > 手机使用 分享 复制链接 新浪微博 分享QQ 微信扫一扫 微信内点击右上角“…”即可分享 反馈 收藏 举报参考答案: Macromolecular;macromolecular 复制 纠错 举一...
蛋白质结构数据库pdb中,mmcif格式是___ crystallographic(晶体) information file的简写. 暂无答案 更多"蛋白质结构数据库pdb中,mmcif格式是___ crystallographic(晶体) information file的简写."相关的问题 第1题 蛋白质结构数据库pdb属于一级数据库 点击查看答案 第2题 pdb数据库中,蛋白质结构的保存格式是 a,二...
M. D. The PDB format, mmCIF formats, and other data formats. In Structural bioinformatics; Bourne, P. E.; Weissig, H., Eds.; Wiley-Liss: Hoboken, New Jersey, 2003.J. D. Westbrook and P. M. D. Fitzgerald, in The PDB format, mmCIF formats, and other data formats. Struc tural ...
关于PDB文件的格式描述正确的有哪些?A.PDB文件用文本方式记录蛋白结构信息B.PDB文件内容包括题头和坐标两部分信息,其中蛋白结构信息存储在题头部分C.以mmCIF的
–>{pdb}_deposited_chemically_distinct_molecules_{view}_image-{size}.png assembly– For each assembly listed in the mmCIF file, create images of the whole assembly, colored by chains and colored by entities. –>{pdb}_assembly_{assembly}_chain_{view}_image-{size}.png ...
PDBeCIF Documentation PDBeCIF is a package that is used to work with mmCIF formatted files. The package ontains modules for accessing mmCIF data in different ways depending on the type of task required. The first mechanism (while slower) allows users to access ANY mmCIF formatted file and incl...
The PDB now provides a key information resource for the structural biology community. A software framework has been developed that supports automation and scalability, and that can adapt to changes in data content and delivery technology, to permit future development. The mmCIF data dictionary and ...
The life and times of the PDB format – looking towards the future with mmCIFdoi:10.1107/S0108767321098068Gregg CrichlowCatherine LawsonJohn WestbrookStephen BurleySanja AbbottKumaran BaskaranJohn BerrisfordZukang FengYasuyo IkegawaMasashi Yokochi