The pdbqt format is 'pdb' plus 'q' for partial charge and 't' for AD4 atom type. Special ...
如题,附件是我的蛋白pdb格式再转化成pdbqt格式时候出现问题,求帮助! 下载提醒:APP中打开可直接下载,点击下载 3loopadfinal.pdb 返回小木虫查看更多分享至: 更多 今日热帖voro++软件... sybyl安装求... MS中label... COMPASS力... 在MS气液界面模... 求大神指点,MS... Reaxff 模... lammps g...精华...
求助求助大神!!!autodock软件pdb格式转pdbqt不成功。。。2016/0303/w226h3620673_1457011085_522.png|bcs|12016/0303/w226h3620673_1457011085_522.png|bcs|1
有没有uu知道为啥open babel转pdbqt为pdb时,小分子配体结构会断裂呀?我autodock里做的对接,对接结果转化为pdb后在pymol和discovery studio中可视化,发现小分子结构断了赞 回应 转发 赞 收藏 只看楼主 念禾 2024-01-12 20:35:06 江苏 楼主,你的问题解决了吗?我的结果也是这样 ...
方法很多，我列举一下： 1、DOCK程序中有个工具叫sdf2mol2，一听这个名字就知道是将sdf文件转化为mol2的。不过你需要和DOCK官方网站申请DOCK程序。 2、Openbabel或者Babel 这个软件非常好用，不过如果sdf是包含多个分子的文件，转化有些麻烦
autodock中PDB转pdbqt时，会出现error:cannot create the pdbqt file,all atoms do not have an auto...
你没加电荷吧，这个上面有提示的
检查一下路径 发自小木虫Android客户端
检查一下路径 发自小木虫Android客户端