相关知识点: 试题来源: 解析 PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵(scoringmatrix)。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择,若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM,FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。反馈 收藏 ...
PAM序列的功能和机制 PAM序列在CRISPR-Cas9的作用是非常重要的,它可以帮助Cas9核酸酶识别和切割目标DNA序列。PAM序列有以下几个功能: PAM序列可以区分细菌自身DNA和外来DNA,防止CRISPR-Cas9系统切割错误的DNA。因为细菌自身的CRISPR基因座中没有PAM序列,而外来的病毒或质粒DNA中有PAM序列,所以Cas9只会靶向含有PAM序列的...
"PAM" 是 "Protospacer Adjacent Motif" 的缩写,指的是与目标DNA序列相邻的一小段DNA序列,它在CRISPR-Cas9系统中起到重要的识别作用。PAM序列是CRISPR-Cas9系统用来确认目标DNA的位置的一种关键特征。 在使用CRISPR-Cas9进行基因编辑时,CRISPR引导RNA与目标DNA的protospacer序列匹配,但它也需要识别PAM序列,以确定准确的...
参考答案: PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵(scoring matrix)。记分矩阵中含有对齐时具体使用的... 点击查看完整答案您可能感兴趣的试卷你可能感兴趣的试题 1.问答题BLAST中,E值和P值分别是什么,它们有什么意义? 参考答案:BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。E期望值(E-value)这个数值表示...
更多“什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵,它们的作用是什么,一般BLAST选择使用的矩阵是什么”相关的问题 第1题 BLAST中,E值和P值分别是什么,它们有什么意义? 点击查看答案 第2题 假设你得到一段未知蛋白的氨基酸序列,从你学习到的生物信息学分析方法和软件,设计一个分析流程来分析该未知蛋白的功能和...
PAM序列是什么 CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的敲除、敲入或点突变。
一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变,但这并不意味100次PAM后,每个氨基酸都发生变化,因为其中一些位置可能会经过多次突变,甚至可能会变回到原来的氨基酸。 模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式,即有意义的一段氨基酸片断(如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列),分别比较...
答:PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵(scoring matrix)。记分矩阵中含有对齐时具体利用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择,若要进行突变性质的进化分析时能够利用PAM,FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。 PAM矩阵(Point Accepted Mutation)基于进化的点突变模型,若是两种氨基酸替换频繁,说明自...