生活娱乐 搜试试 续费VIP 立即续费VIP 会员中心 VIP福利社 VIP免费专区 VIP专属特权 客户端 登录 百度文库 其他 paired-end reads的意思paired-end reads的意思 paired-end reads的意思:成对末端读取 ©2022 Baidu |由 百度智能云 提供计算服务 | 使用百度前必读 | 文库协议 | 网站地图 | 百度营销 ...
Paired-end Reads 目前的二代测序技术有单端测序(Single-read)和双端测序(Paired-end和Mate-pair)两种方式。Single-read、Paired-end和Mate-pair主要区别在测序文库的构建方法上。本期主要介绍双端测序中的Paired-end reads 情况。 测序原理 PE/MP 测序也叫双向测序,是对一个长的序列测得其两端的序列。两端的序列...
DNA片段有两条链,那么请问Paired-end reads是指的是来自DNA片段的两端的两条不同的链,还是同一条链???是下面哪一种情况呢?望大侠能给我这只菜鸟解疑= = woshishuidnf 分子生物 1 第一种。 冷却的孤单 分子生物 1 pair-end是新一代测序技术上的术语。是指一段DNA测两端,一般是测不通的,比如一个片...
Paired-end :双末端测序(200-500bp)因为双末端测序,所以中间被测序列称为insert,insert打断了之后的片段就是reads。 Mate-pair:(2000-10000bp):用来生成确定基因中reads位置的短片段(end)。将一类长序列打断成特定大小(只要小于长片段长度即可),之后采用化学方式将其修复(环化等),同时在两端加入生物素标记(这是为...
如何从SRA文件中分离出从对短序paired-end reads 很多时候我们从NCBI的SRA文档中分离paired-end sequencing数据。但是当我们使用SRA toolkit的fastq-dump工具时，往往只能得到一个文件，而不是两个文件。如何才能将这个文件分离成两个或者更多的文件呢？答案是不一定。首先我们可以试试使用fastq-dump的–...
We show that ELOPER theoretically doubles read-lengths while halving the number of reads. We provide evidence that pre-processing read libraries using ELOPER leads to considerably improved assemblies as predicted from the Lander鈥揥aterman model.Availability: http://sourceforge.net/projects/eloper....
距离信息可以用来判定组装后成对 reads 间的序列是否准确,也可 用来帮助组装。这种测序方式可以用来解决基因组中的重复序列难题,被广泛采用。目前在 采用双端测序法时,454 平台建库最长(最长能达到 20k),Illumina 建库长度最短(小于 5k)。 由于 Solid 和 Solexa 都是采用桥式扩增的方式,其本身自带 paired-end ...
5. mate-paired 两端的序列形成”一对”,中间的距离叫插入长度(insert length, ins_length)。PE/MP 测序的结果除了序列本 身外还有中间的距离信息。距离信息可以用来判定组装后成对 reads 间的序列是否准确,也可 用来帮助组装。这种测序方式可以用来解决基因组中的重复序列难题,被广泛采用。。
ELOPER: elongation of paired-end reads as a pre-processing tool for improved de novo genome assembly. Motivation: Paired-end sequencing resulting in gapped short reads is commonly used for de novo genome assembly. Assembly methods use paired-end sequences i... Silver,H David,Ben-Elazar,......
Different types of assembly errors can then be distinguished from the mis-assembled sequence by analyzing the aligned paired-end reads using multiple features derived from coverage and consistence of insert distance to obtain high confident error calls.We tested the performance of misFinder on both ...