echo $startTime4 bwa mem ~/xubo/ref/GRCH38L1Index/GRCH38chr1L3556522.fasta ~/xubo/ref/GRCH38L1Index/pe/g38L100c10000000Nhs20Paired1.fq ~/xubo/ref/GRCH38L1Index/pe/g38L100c10000000Nhs20Paired2.fq > ~/xubo/ref/GRCH38L1Index/pe/g38L100c10000000Nhs20Paired12.sam endTime4=`date +"%s...
我的两个植物样,送去做microRNA的illumina HiSeq测序,公司给我送回来的数据是paired-end类型的,每个样品都有两个同样大小的序列文件,分别存储microRNA的序列及其反向互补序列。 现在在前期过滤序列时遇到了问题了,同一个样品的两份数据因为其测序质量不一样,过滤掉的reads就可能不一样。我的问题是后续分析都只需一...
序列R末端配对末端anddataDatawithend序列数据 系统标签: pairedendsequence配对序列data FindingStructuralVariantsinShortRead, Paired-endSequenceDatawithRand Bioconductor SeanDavis NationalCancerInstitute, NationalInstitutesofHealth Bethesda,MD,USA sdavis2@mail.nih.gov July2,2010 Abstract Second-generationsequencing...
QIIME2导入数据 | 使用QIIME2进行分析,下面这样导入数据:qiime tools import \ --type 'SampleData[PairedEndSequencesWithQuality]' \ --input-path manif.txt \ --output-path out.qza \ --input-format PairedEndFastqManifestPhred33在导入数据时有如下报错:There was a problem importing manif,txt:/tmp/...