Pacbio Sequel II 平台早期支持CLR(Continuous Long Reads)和CCS(Circular Consensus Sequencing)两种测序方式。 CLR模式适用超长片段文库(> 25 kb),对下机的subreads数据不再进行后续处理,可以直接使用,用作下游分析的原始数据,唯一的缺点就是每条reads准确度低一些。 从2022年下半年起,最新的建库试剂盒SMRTbell prep...
PacBio Sequel II 测序Polymerase reads 平均读长可达 25kb 以上,N50 在 35kb 以上,另外目前单个 SMRT Cell 产量有大幅提升,安诺基因目前CLR模式单个 SMRT Cell 的数据产量平均在 110Gb 左右,而CCS模式平均单个SMRT Cell 的数据产量位250Gb左右。 SequelII平台酶读长展示 B.高一致性准确度 PacBio SMRT 测序的原...
Pacbio Sequel II 平台早期支持CLR(Continuous Long Reads)和CCS(Circular Consensus Sequencing)两种测序方式。 CLR模式适用超长片段文库(> 25 kb),对下机的subreads数据不再进行后续处理,可以直接使用,用作下游分析的原始数据,唯一的缺点就是每条reads准确度低一些。 从2022年下半年起,最新的建库试剂盒SMRTbell prep...
具有链置换性的聚合酶在聚合反应开始后将正负链解链),从图中可以看出1分子Template(Prmier):Polymerase复合物被固定在了ZMW底部,理论上SMRT bell文库两端发卡状接头均会结合测序引物和聚合酶,因此文库的两端均会发生聚合反应并生成对应的测序链,但只有在ZMW底部的聚合链的碱基信息可以被采集。
我们对某植物样本分别构建1-10、4-10Kb双文库和1-10Kb单文库,然后在PacBio Sequel II平台测序,结果表明双文库Isoform的平均长度较单文库提升了1Kb以上,大于3Kb的转录本个数和所占比例也呈现出显著差距。 不同建库策略的数据表现 由上表展示数据可以看出,构建双文库对于获取长的Isoform信息是非常必要的,因为双文库相...
PacBio Sequel的SMRT Cell芯片相较上一代的RSII大了一些,样子变化也较大。 芯片上黑色柱状体用于机械臂插取、移动芯片。右下角的圆形凹槽为激光射入点,红绿混合激光从该点射入均匀的照射在金灿灿的芯片底部(图中闪着金光的矩形部分即为拥有100万个ZMW的测序芯片)芯片作为一个独立的无盖长方体反应槽的底部,机器臂...
此后,PacBio又在2019年和2020年分别推出了Sequel II和Sequel IIe高通量测序仪,进一步提高了测序精确度,并且与多个项目和公司展开合作,如SolveRD项目、All Of Us项目等。 HiFi测序是所有PacBio长读测序仪器上运行的核心化学技术,是PacB...
使用动物DNA构建20 kb文库进行1个SMRT®Cell测序,共计产出102.84 G,获得Unique Molecular 序列83.17 G,酶读长平均长度15 kb,N50为25 kb,Subreads平均长度为12.4 kb,N50为19.2 kb。 从目前展示的实测数据来看,安诺基因Sequel Ⅱ单个SMRT®Cell数据产出超过100 G,较官方发布的数据(平均80 G)相比在通量上具有很...
此后,PacBio又在2019年和2020年分别推出了Sequel II和Sequel IIe高通量测序仪,进一步提高了测序精确度,并且与多个项目和公司展开合作,如SolveRD项目、All Of Us项目等。 HiFi测序是所有PacBio长读测序仪器上运行的核心化学技术,是PacBio的科学家基于基因组分析中对长度和准确性的双重需求所开发,为基因组学研究提供了...
三、测序文库检测对最终环化后未经外切酶消化直接回收的5组样品的pacbio测序文库分别采用pacbiosequelii测序平台进行hifi测序,数据产量均超过200gb(表2),与常规大量(大于等于5ug)dna输入的酶连接pacbio建库方法测序的数据产出量相仿。另外还对一个外切酶消化后的文库进行hifi测序后数据产量达到306gb。表2测序数据产量pac...