结果表明,在PacBio Sequel II平台上的总数据产出为307.43GB,单个样本的数据量也在120GB以上,是PacBio Sequel平台数据产出的10倍多,并且Sequel II平台的酶读长高达57,674bp,远远高于Sequel平台,这意味着产出数据的准确性大大增加。同时,在PacBio Sequel /Sequel II两个平台上双文库混样测序数据的拆分效率都能达到95...
6、提高准确性需要牺牲测序长度和数据量; 二、pacbio的主要应用 三、pacbio的进化 2003年5月:成立; 2010年:PacBio RS,3K,90M; 2013年4月:PacBio RS II,15万ZMW小孔,通量0.5~1G; 2015年:Sequel System,100万ZMW小孔,通量5~10G; 2019年4月:Sequel II,800万ZMW小孔,通量20~50G;hifi reads。 2020年10月...
HiFi Reads全称High fidelity reads, 是PacBio公司基于Sequel II平台产出的兼具长读长和高准确度的测序序列,该测序模式(CCS测序模式)一经问世,备受广大组学科研用户关注——其超长读长完美规避了二代测序short reads的天生不足,高准确度也远超之前的Sequel I平台CLR模式的,非常有助于组学研究者进一步优化数据结...
对于我们这种每年处理数万个微生物样本的实验室而言,Sequel II系统有望实现真正深入且经济高效的微生物组和宏基因组测序。” Michael Hunkapiller Pacific Biosciences首席执行官Michael Hunkapiller博士说:“我们对早期试用测试的结果很满意,...
PacBio Sequel II 测序Polymerase reads 平均读长可达 25kb 以上,N50 在 35kb 以上,另外目前单个 SMRT Cell 产量有大幅提升,安诺基因目前CLR模式单个 SMRT Cell 的数据产量平均在 110Gb 左右,而CCS模式平均单个SMRT Cell 的数据产量位250Gb左右。 SequelII平台酶读长展示 ...
通过16S rRNA测序分析溴氰菊酯抗性和敏感的白纹伊蚊之间肠道微生物群的差异,以及溴氰菊酯处理前后两种白纹伊蚊肠道微生物的变化,得到与溴氰菊酯抗性有关的菌株,并通过分离培养获得相应菌株。实验设计 测序方案:16S rRNA 测序平台:PacBio Sequel II 数据量:LC50溴氰菊酯处理前得到63,299条(平均每只蚊308.78条)...
测序平台:PacBio Sequel II 数据量:LC50溴氰菊酯处理前得到63,299条(平均每只蚊308.78条),纯化后序列总数为62,835条;处理后得到156453条序列,纯化后序列总数为151133条。 主要结论 ①两种白纹伊蚊菌株的肠道微生物群的多样性和丰度存在显着差异; ②体外培养的共生菌主要是兼性厌氧菌, ③培养的细菌如米沙雷氏...
4月22日,PacBio SMRT测序技术高峰论坛在北京召开,本次会议上PacBio 官方首次发布了备受瞩目的Sequel II测序平台。配置了全新的8M SMRT Cell,Sequel II单张芯片通量较Sequel平台提升了8倍左右,数据质量方面也有明显改善。 安诺优达作为全...
PacBio RS II长读长测序reads无GC偏好,能够全面获得基因组的遗传变异,包括SNPs的鉴定到CNV、SV结构变异等,可运用至人类癌症基因组重测序等。PacBio Sequel平台10小时即可完成测序,可应用至需要快速反馈的临床检测中,如细菌感染疾病中细菌的鉴定、病毒的鉴定等,取样开展重测序和目前已有的细菌、病毒基因组数据库进行比...
此后,PacBio又在2019年和2020年分别推出了Sequel II和Sequel IIe高通量测序仪,进一步提高了测序精确度,并且与多个项目和公司展开合作,如SolveRD项目、All Of Us项目等。 HiFi测序是所有PacBio长读测序仪器上运行的核心化学技术,是PacBio的科学家基于基因组分析中对长度和准确性的双重需求所开发,为基因组学研究提供了...