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SIMCA14软件的使用(HCA、PCA、OPLS-DA分析), 视频播放量 1989、弹幕量 0、点赞数 11、投硬币枚数 6、收藏人数 22、转发人数 3, 视频作者 在学习的小鱼丸, 作者简介 中药学研二|复方神经药理方向欢迎私信交流,相关视频:SIMCA14的使用(3),SIMCA14软件的使用(2),40分
主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘法(OPLS)是有监督的模式,它们使用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型,实现对样品类别的预测,是一种建模类型的方法 相较而言...
PLS-DA能按照预先定义的分类(Y变量)最大化组间的差异,获得比PCA更好的分离效果。 正交偏最小二乘判别分析(Orthogonal PLS-DA,OPLS-DA )是一种有监督的判别分析方法,是多变量统计分析方法。OPLS-DA综合了PLS-DA和正交信号过滤(orthogonal signal correction, OSC)技术,能够把与预先设定的和分类无关的信息最大程...
说PCA是unsupervised, OPLS是supervised,可是做PCA的时候我也是知道我的组别的啊,为什么说PCA不知道组的...
OPLS-DA分析中,S-plot图帮助识别与主成分和分类相关性强的代谢物,同时评估模型的R2X、R2Y和Q2值,反映模型对X和Y矩阵的解释率以及预测能力。验证图通过permutation test确定模型的最优性。要进行PCA、PLS-DA、OPLS-DA分析,可以使用如MetaboAnalyst这样的在线平台,它提供从数据预处理到模型构建和图形...
PCA->OPLS-DA的分析方式是把陈皮类别当特征,特定检测方式的检测值分布当结果,检验数据拟合模型的数据分布的判别分析。这与SVM的把多种检测方式检测出的数据当特征,陈皮类别当结果,检验特征与类别之间的分类回归算法的单样本记录分类偏好拟合,而不关心分布信息的方式不同。
PLS-DA/OPLS-DA二维图。不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一种有监督的 - BTP生物科技于20231201发布在抖音,已经收获了5个喜欢,来抖音,记录美好生活!
仪器种类:型号:基础对比分析PCA OPLS-DA 详细参数和报价申请演示询 价 产品简介 对样本进行主成分分析能从总体上反应各组样本之间的总体代谢差异和组内样本之间的变异度大小。使用SIMCA软件(V14.1, Umetrics, Umea, Sweden)对数据进行UV格式化(Unit Variance Scaling)和平均中心化(Mean-Centered)处理,然后进行自动建模...
本模块提供了各种常用的统计和机器学习方法,包括t检验,方差分析,PCA, PLS-DA和正交PLS-DA。它还提供了聚类和可视化工具来创建树状图和热图,以及根据随机森林和SVM对数据进行分类。 1.上传数据 Fig1.PNG 如果你上传的列表中每一列为一个样本,Format选择Samples in columns;如果每一行为一个样本,Format选择Samples ...