在大多数模拟中,用nvt或者npt都可以。 以拉伸为例,使用deform进行拉伸,系综可以为nvt,也可以为npt,不过在npt下更有容易模拟泊松效应。 使用velocity方式进行拉伸,在拉伸方向只能为s边界,使用nvt系综更方便。 nvt和npt系综也可以配合使用,比如,对于比较复杂的模型,可以先进行nvt系综下弛豫,然后再进行npt系综下的弛豫。
lammps中NVT，NPT是表达控温或者控温控压的意思，与NVT系综，NPT系综中的恒温或者恒温恒压并不相同 ...
npt系综语法与nvt相似，额外包含Pstart、Pstop、Pdamp参数控制压力，Pdamp通常设置为1000*timestep。npt在控制压力方向上需保证边界条件为p。4. 选择依据 选择系综取决于模拟体系和目的。nve系综适用于不需要控温、体系内能量相互转换的模拟，如石墨烯卷曲。nvt或npt系综在大多数模拟中应用广泛。以拉伸为例...
分子动力学 nvtnpt先后顺序 1. 初始化系统 在进行分子动力学模拟之前,首先需要初始化系统。这包括确定模拟的分子体系、定义分子的初始位置和速度、设置模拟的时间步长等。通过合理的初始化,可以使模拟系统更加接近实际情况,提高模拟结果的可靠性。 2. 纳入外部场 在分子动力学模拟中,我们可以通过纳入外部场来模拟分子...
在nvt系综下驰豫,box体积保持不变,原子在力的作用下抱团收缩,原子之间的距离变小,原子总体积小于box体积,从而产生空洞。 这种情况下就不能再用nvt进行驰豫。 npt系综根据原子总体积的变化自动调整box的尺寸,比较适合当前的体系,于是把nvt改为npt。 在npt下驰豫后发现合金在开始阶段有比较大的收缩,收缩之后空洞消失,...
fix命令下通过nvt和npt的控温参数是用temp关键词来进行设定。其它控温相关的关键词包括tchain、tloop和drag,下面对此进行讨论。 控温器仅仅应用在拥有平移自由度的粒子。平移自由度可以在进行控温前移除偏速度(bias velocity),参见下面进行的讨论。期望的温度在运行的每一个时间步都随着Tstart到Tstop不断上升。Tdamp参数...
npt语法: fix ID group-ID npt temp Tstart Tstop Tdamp Pstart Pstop Pdamp 1. npt语法和nvt差不多,只不过多了Pstart Pstop Pdamp三个参数进行压力控制。 Pstart、Pstop分别为初始压力、结束压力,Pdamp压力调节阻尼系数,通常为1000*timestep。
fix NVT/NPT/NPHlammps.sandia.gov/doc/fix_nh.html#fix-npt-command 补充部分在段落结尾以“添注”形式补充。 语法: fix ID group-ID style_name keyword value ... ID 是fix名,group-ID是fix所作用的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。
npt系综根据原子总体积的变化自动调整box的尺寸,比较适合当前的体系,于是把nvt改为npt。 在npt下驰豫后发现合金在开始阶段有比较大的收缩,收缩之后空洞消失,得到比较致密的合金组织,完美解决问题。 多数情况下,用nvt系综进行驰豫即可,但部分体积变化比较大的体系,用npt系综进行驰豫效果会更好。
LAMMPS中的系综（NPTNVT）命令 LAMMPS中的系综（NPTNVT）命令 语法：fix ID group-ID style_name keyword value ...ID 是fix名，group-ID是fix所作⽤的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword = temp or iso or aniso or ...