NVT显然是等温等容（正则）系综，NPT是等温等压系综。和nvt.mdp中的gen_vel，gen_temp，gen_seed参数...
up,我想问问输入后没有产生ions.tpr文件,出现如图的报错,是哪里出问题了呢
这个并不是从初始温度到目标温度的时间步数目的数值。具体见lammps使用手册中fix npt命令的说明。
然后将nvt.mdp npt.mdp md.mdp的ref_t部分改成了255 K，开始模拟。根据模拟过程中相应的notes和...
水箱+研究体系）突然缩小。关于类似的问题，有人说可以先跑NVT，然后再跑NPT。
用于Python 和 Cython 统计力学的 Metropolis Monte Carlo 粒子模拟。 在 NVT 和 NPT 集合中使用马尔可夫链方法模拟 Lennard-Jones 粒子。 包括随机数生成器、随机游走、Ising 模型示例以及 SPC/E 模型中水分子的额外 Metropolis 模拟,具有试验平移和单位四元数旋转。
“不要以为和你关系好的人就会善待你,人心经不起揣测,保持分寸,时常理性,熟人有时候比陌生人还可怕!” û收藏 18 1 ñ57 评论 o p 同时转发到我的微博 按热度 按时间 正在加载,请稍候... 情感博主 查看更多 a 220关注 262.4万粉丝 60843微博 微关系 她的关注(219) ...
蛋白配体复合物动力学模拟(三)NVT、NPT平衡和动力学模拟 up,我想问问输入 后没有产生ions.tpr文件,出现如图的报错,是哪里出问题了呢
水箱+研究体系）突然缩小。关于类似的问题，有人说可以先跑NVT，然后再跑NPT。
① 我对模拟时间100ns、模拟尺度500粒子数的NPT水盒子，使用g_energy_mpi -f npt100.edr -b 50000...