值得注意是里面的NK-HSP仅仅是因为NK细胞有HSP的状态,其实也可以是干扰素状态,炎症状态,或者细胞增殖状态,具体情况具体分析,并不是通用的知识点。 另外一个数据集GSE130430,来源于文章:《Heterogeneity of human bone marrow and blood natural killer cells defined by single-cell transcriptome》,可以看到这个时候的CD...
文章题目:Single-cell RNA-seq reveals altered NK cell subsets and reduced levels of cytotoxic molecules in patients with ankylosing spondylitis日期:2022-01-06期刊:Journal of Cellular and Molecular Medicine链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/jcmm.17159 摘要 强直性脊柱炎 (AS) 是脊柱...
期刊:CELL 导语 尽管以T细胞为中心的免疫疗法已经取得了无可争议的临床成功,但数量有限的获得持久响应的患者迫切需要补充的治疗策略。NK细胞,作为肿瘤微环境中一类重要的组成部分参与肿瘤控制的多个过程,如直接的杀伤细胞和分泌促炎因子等。利用NK细胞进行癌症治疗已提出了大量的策略,其特点是有希望的特性,包括其安全性...
46. Philippa M. Saunders, J. Vivian et al. “A bird's eye view of NK cell receptor interactions with their MHC class I ligands.” Immunological Reviews (2015). 47. F. Karlhofer, R. Hunziker et al. “Host MHC class I molecules ...
期刊:CELL 影响因子:66.85 技术服务:scRNA-seq 导语尽管以T细胞为中心的免疫疗法已经取得了无可争议的临床成功,但数量有限的获得持久响应的患者迫切需要补充的治疗策略。NK细胞,作为肿瘤微环境中一类重要的组…
近日，芬兰赫尔辛基大学医院综合癌症中心Satu Mustjoki团队和美国哈佛大学医学院Constantine S. Mitsiades团队联合在Immunity杂志上发表了题为Single-cell functional genomics reveals determinants of sensitivity and resistance to natural killer cells in blood cancers的文章。该文章利用基于单细胞转录组测序技术（scRNA-seq...
可以看到上面的NK细胞细分,都是基于单个数据集,有很强烈的片面性,那么张泽民课题组的泛癌层面数据挖掘文章,2023年9月发表在CELL的《A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells》,就很好的解决了这个问题。在NK单细胞亚群里面主要是CD56和CD16,其实对应的基因名字是NCAM1和FCGR3A ,它们在单...
对NK细胞取子集进行细分,得到1个mast cell和3个NK细胞cluster,从NK细胞毒性激活/抑制,细胞通讯,NK细胞功能相关的标志物,NK细胞介导的毒性通路等角度进行分析,并用NLH单细胞转录数据集进行验证 对上皮细胞取子集进行细分,用copykat鉴定良性和恶性上皮细胞,对恶性上皮细胞再进行细分,得到tumor1和tumor2两类,考察多个关...
2023年8月21日，张泽民教授团队成员联合中国科学技术大学彭慧教授课题组，在《Cell》杂志上发表了题目为“A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells”的论文，该研究收集整理了大量公开的单细胞转录组数据，涉及24种癌症类型，包括来自716名患者的1223个样本的NK细胞单细胞表达谱数据。该研究...
期刊:CELL 导语 尽管以T细胞为中心的免疫疗法已经取得了无可争议的临床成功,但数量有限的获得持久响应的患者迫切需要补充的治疗策略。NK细胞,作为肿瘤微环境中一类重要的组成部分参与肿瘤控制的多个过程,如直接的杀伤细胞和分泌促炎因子等。利用NK细胞进行癌症治疗已提出了大量的策略,其特点是有希望的特性,包括其安全性...