NHANES数据为XPT格式,也就是SAS软件的格式,可以使用SAS Universal Viewer查看,也可以使用SUDAAN、SPSS、Stata和R软件包传输文件。本文介绍R语言下载数据、合并数据的流程。 3.1安装R语言(https;//cran.r-project.org/) 3.2安装R Studio (https;//rstudio.com/products/rs) 3.3导入数据 启动R Studio,创建新的R脚本...
以我们NHANES文献中常见的RCS为例,R语言的分析主要用到survey包,各个参数变量需要一一指定,但是使用郑老师开发的统计平台,只需3步!不到1分钟直接出结果! 一站式完成NHANES加权分析! 它的网址是: www.zstats.cn/software2/NHS_statistic_all/ NHANES加权板块,目前的功能包括: NHANES数据菜单式下载 分组差异性分析 ...
NHANES数据处理(R语言进行数据筛选和剔除) 目标:用已有的数据指标来定义参与者是否患有高血压,数据来源2013-2014年NHANES数据库。 我们首先查阅相关文献,了解到高血压的定义是收缩压(SBP)>=140,或舒张压(DBP)>=90,或自我报告服用降血压药物。我们根据这些指标来选取我们所需要的数据集并导入。 install.packages("fo...
今天给大家分享文章Dietary pattern and diversity analysis using DietDiveR in R: a cross-sectional evaluation in the National Health and Nutrition Examination Survey,该文章分享了R包DietDiveR ,其为用户提供以下功能: 1) 清理饮食数据 2) 分析与其他研究特定元数据变量相关的 24 小时饮食摄入量 3) 可视化常...
1. 导入“foreign”库:首先,我们需要安装并导入“foreign”库,以便使用其中的函数。在R环境中运行`library(foreign)`。 2. 读取.xpt文件:使用foreign库中的`read.xport()`函数读取NHANES数据。例如,如果下载的文件名为“pfas_j.xpt”,则可以将数据存储到名为“pfas”的对象中,代码如下: ...
二、R语言复现 本次复现包括的统计学方法有: 基线差异性分析 绘制KM曲线 COX回归多模型控制混杂 趋势性分析P trend 绘制非限制性立方样条图(RCS) 01:数据导入与预处理 首先,导入我们从NHANES数据库中提取处理好的数据,本次复现数据包括19481名研究对象(原文章n=23110),样本量略有出入,这里大家请多关注统计方法的...
在读取数据之前,需要先查询到我们需要的数据,在nhanesR包中,我们提供了nhs_files_pc()命令来查询本地数据库的文件,在nhs_files_pc()命令中,有以下几个重要参数。 ·years:年份,默认所有所有年份 ·items:5大项目,忽略大小、左匹配、默认所有项目 ·pattern:文件名中包含的字符 ·file_ext:文件扩展名,默认是所...
nhanesR中一个数据怎么看有没有缺失或者是没有完成检查呢,在数据建模前,需要查看每一列数据的缺失情况,当缺失值的占比超过一定阈值,就需要考虑,这一列数据(或者这一个变量)是否需要参与建模。一般选用的阈值在0.9,即:当某一个变量的缺失值占比达到90%以上,就需要
NHANES 是国家卫生统计中心 (NCHS) 的一项重大计划。NCHS 是疾病控制和预防中心 (CDC) 的一部分,负责为国家提供重要和健康统计数据。 NHANES 计划始于 1960 年代初,并作为一系列针对不同人群或健康主题的调查进行。1999 年,该调查成为一项持续性计划,其重点不断变化,关注各种健康和营养测量,以满足新出现的需求。该...
nhanesA R 软件包的开发是为了让研究人员能够轻松地 从国家健康与营养中探索和检索数据 检查调查 (NHANES)。该调查评估了整体健康状况和 在美国对成人和儿童进行营养,并进行 由国家卫生统计中心(NCHS)提供。NHANES数据是 公开提供于:https://www.cdc.gov/nchs/nhanes.htm,并在 每年有数以千计的同行评审期刊出版...