该部分显示目的ncRNA官方名称、全称、类型、物种、别名、染色体位置和其他数据库的ID。ncRNA Association Statistics 该部分显示目的ncRNA关联疾病，表格中仅显示关联较高的部分疾病，点击表格第一行的More Information可查看目的ncRNA关联的所有疾病。Disease Information 该部分显示目的疾病的定义、类型和别称，信息来源于Diseas...
LncACT-State 该部分可查看疾病样本特征，如血管生成、细胞凋亡、细胞周期、侵袭、增殖等，输入TCGA或GEO数据库的样本编号点击Submit即可查看。LncACT-Tree 该部分可以查看某个疾病中是否包含指定ceRNA。选择疾病，输入lncRNA和mRNA名称，点击Submit后页面下方出现所有相关疾病样本，并标注是否包含ceRNA。点击样本编号可查看...
快速搜索输入lncRNA名称结果页面如下，表格显示ncRNA、miRNA和mRNA的名称，mRNA物种，疾病，文献来源。表格左上角可选择结果下载的文件格式，右上角可输入关键词查看相关内容。点击Pubmed链接可直接查看文献。点击表格最左侧detail可查看ceRNA详情，包括实验验证的组织细胞、实验方法、来源文献和ceRNA功能描述。Patients with ...
既然这么重要,那么今天我们就来给大家介绍一个存储疾病相关ncRNA的数据库:MNDR v3.1(http://www.rna-society.org/mndr/)。该数据库目前包含超过一百万个ncRNA疾病条目,包括6,301多种miRNA,39,880多种lncRNA,20,256 circRNA,10,894 piRNA和521个snoRNA,它们具有1,600多种疾病,并且物种覆盖率增加到11种哺乳动物。
EVAlats数据库首页 该数据库具有四个功能模块：(i)浏览和比较来自24种条件和8个来源（血浆、血清、唾液、尿液、精子、母乳、原代细胞和细胞系）的数据；(ii)根据其表达优先考虑条件相关组织中的候选ncRNA；(iii)探索24种条件下EV中特异性表达的ncRNA；(iv)研究ncRNA功能、相关药物、靶基因和EVs分离方法。EVAtlas...
近年来,植物非编码RNA(ncRNAs)领域取得了重大进展,许多ncRNAs被认为是植物发育和胁迫反应中基因表达的重要调节因子。此外,这些ncRNA的编码潜力,产生ncRNA编码肽(ncPEPs),已成为一个重要的研究领域。然而,现有的植物ncRNA数据库缺乏关于ncRNA...
deepBase v3.0还通过整合来自大型数据库(包括ENCODE、TCGA、ICGC和GTEx项目)的测序数据,为正常组织和癌症组织中的lncRNA和其他ncRNA提供了最全面的表达谱。通过分析来自ERCC的测序数据,我们解码了miRNA,lncRNA和circRNA的细胞外模式。此外,deepBase v3.0 提供了多种新的 Web 模块和图形可视化,以促进对各种类型ncRNA的...
NSDNA:神经系统疾病相关的 ncRNA 数据库 神经系统疾病是一类由于中枢神经系统或者周围神经系统受到影 响从而引起的疾病,包括脑血管疾病,周期性麻痹等多种疾病。 ncRNA 全称为非编码 RNA,是一类 RNA,包含了 miRNA,lncRNA, piRNA, siRNA 等多种非编码 RNA, 科学研究证实,ncRNA 在多种疾 病中扮演重要角色。 NSDNA...
该数据库不仅从文献中整理出了实验证据支持的疾病相关的ncRNA, 还整合了LncDisease,miRPD等数据库。通过检索系统,可以得到与疾病相关的ncRNA, 示意如下 点击more, 可以查看详细信息,包含以下几种信息 1. Basic Information 2. ncRNA Information 3. Disease information ...
NSDNA是一个数据库,开发者从文献中收集整理了ncRNA相关的神经系统疾病,目前包含来自11个物种,8736个ncRNA, 144种神经系统疾病,共26128个ncRNA与疾病之间的关联数据,网址如下 http://www.bio-bigdata.net/nsdna/ 各种ncRNA与疾病关联的数据汇总如下 miRNA-associated entries: 21384 lncRNA-associated entries: 4608 ...