1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
1.CDD⼊⼝：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/，该⼯具为NCBI提供的，NCBI主页选项⼝选择进⼊Conserved Domain然后点击Search。然后选择CD-search（单个基因），或者Batch CD-Search（多个基因）。attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进⼊：粘贴基因...
ncbi CD search结果解读由于基础知识薄弱,利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后,对显示的结果看不大明白。向各位求教,谢谢! 图中specific hits中为什么右边是锯齿形状呢,还有这图形颜色有什么含义吗?有锯齿是说明我的序列不完整嘛?如图一 有的结果在non-specific hits中也有匹配到的结果,这应...
自2022年9月以来,我们向SPARCLE添加了超过4500个经过整理和发布的域结构(特定和超家族),这些信息可在保守域搜索(CD-Search)结果和蛋白质家族数据库中获取。 这些结构提供了蛋白质产物名称和蛋白质属性,如基因本体(GO)术语、酶委员会(EC)编号、PubMed ID以及来自其他资源的ID,例如转运蛋白分类数据库(TCDB)、MEROPS...
看到cd-search可以批量预测AA序列的保守结构域，但似乎不能批量预测DNA序列的保守结构域，请问有没有人...
Bustamante CD[au] - PubMed - NCBIPubMed comprises more than 23 million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. Citations may include links to full-text content from PubMed Central and publisher web sites.pubmeddevGene...
关于ESearch 的官方文档https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25499/#chapter4.ESearch 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 from BioimportEntrez #===在数据库搜索基因===# 搜索 Xenopus laevis 物种中名为 oct4 的基因 handle=Entrez.esearch(db="gene",term="oct4[Gene] AND Xenopus...
在NCBI官网主页选择数据类型“SRA”，搜索框输入关键词“16S”，选择“Search”按钮执行搜索。弹出搜索结果...
Skip to main content. All Chemicals and Bioassays Resources. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Sequence Read Archive (SRA). All DNA and RNA Resources. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Conserved Domain Search Service (CD Search). Vector