Sequence Read Archive(SRA,以前称为 Short Read Archive)是一个生物信息学数据库,为 DNA 测序数据提供公共存储库,多是高通量测序产生的“短读长”,通常少于 1,000 个碱基对在长度上。该数据库是国际核苷酸序列数据库合作组织(INSDC)的一部分,由 NCBI、欧洲生物信息学研究所(EBI) 和日本 DNA 数据库(DDBJ) 共...
Sequence Read Archive(SRA,以前称为 Short Read Archive)是一个生物信息学数据库,为 DNA 测序数据提供公共存储库,多是高通量测序产生的“短读长”,通常少于 1,000 个碱基对在长度上。该数据库是国际核苷酸序列数据库合作组织(INSDC)的一部分,由 NCBI、欧洲生物信息学研究所 (EBI) 和日本 DNA 数据库 (DDBJ) ...
Trace Archives数据库储存了由凝胶/毛细血管测序平台(例如Applied Biosystems ABI 3730)测序(一代测序)获得的序列数据。 6.1.3 Short Read Archive Short Read Archive(SRA)数据库里收录的数据都是由新一代测序仪(例如Roche-454、Illumina Genome Analyzer、AppliedBiosystem...
Short Read Archive(SRA)数据库里收录的数据都是由新一代测序仪(例如Roche-454、Illumina Genome Analyzer、Applied Biosystems SOLiD System platforms)测序产生的基因序列信息。从2007年开始,SRA已经迅速累积到了1.3 Tbp,共180亿条小片段,约占人类基因组序列总长度的85%。SRA的出现为大家进行数据挖掘提供了更多的机会。
Short Read Archive(SRA)数据库里收录的数据都是由新一代测序仪(例如Roche-454、Illumina Genome Analyzer、Applied Biosystems SOLiD System platforms)测序产生的基因序列信息。从2007年开始,SRA已经迅速累积到了1.3 Tbp,共180亿条小片段,约占人类基因组序列总长度的85%。SRA的出现为大家进行数据挖掘提供了更多的机会...
Accession numbers for NCBI Short Read ArchiveCox, Robert MCox, Christian LMcGlothlin, Joel WCard, Daren CAndrew, Audra LCastoe, Todd A
Short Read Archive(SRA)数据库里收录的数据都是由新一代测序仪(例如Roche-454、Illumina Genome Analyzer、Applied Biosystems SOLiD System platforms)测序产生的基因序列信息。从2007年开始,SRA已经迅速累积到了1.3 Tbp,共180亿条小片段,约占人类基因组序列总长度的85%。SRA的出现为大家进行数据挖掘提供了更多的机会...
NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、BLAST、Pimer-Blast、COBALT、RefSeq、UniGene、HomoloGene、ProtEST、dbMHC、dbSNP、dbVar、Epigenomics、the Genetic Testing Registry、Genome和相关工具、比对查看器、跟踪存档、Sequence Read Archive、...
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Sequence read archive (SRA)序列读取存档 (SRA) Para_18 NCBI 庆祝 SRA 数据上云三周年,目前数据总量已超过 25 艾字节。 其中包括超过 2700 万个公开的 SRA 文件,既有规范化格式也有精简格式,以及相关元数据和 STAT 分析。 这些数据可在亚马逊网络服务开放数据项目和谷歌云平台公共数据集项目中获取(ncbi.nlm....