进入https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,在左侧下拉菜单选择“Assembly”,输入刚才找到的基因组编号: 03、搜索及下载: 点击搜索,进入该基因组的组装信息界面,可见该基因组仅被录入GenBank而未被RefSeq收录(蓝框),因此我们选择下载基因组。点击右侧“Download the GenBank assembly”(图中红框): 04、进入下载页面: 可...
GenBank:一个公共的核酸序列数据库,包含所有公开可用的DNA序列的注释集合。 refseq: 经过筛选和注释的参考序列的数据库。RefSeq数据库的目的是提供一套全面、集成、非冗余、注释良好的序列,包括基因组DNA、转录本和蛋白质。RefSeq序列构成了医学、功能和多样性研究的基础,它们为基因组注释、基因鉴定和表征、突变和多态...
3、找到NCBI Reference Sequences (RefSeq)，它分为几个板块，第一个mRNA and Protein区可以让我们找到...
进入https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,在左侧下拉菜单选择“Assembly”,输入刚才找到的基因组编号: 03、搜索及下载: 点击搜索,进入该基因组的组装信息界面,可见该基因组仅被录入GenBank而未被RefSeq收录(蓝框),因此我们选择下载基因组。点击右侧“Download the GenBank assembly”(图中红框): 04、进入下载页面: 可...
②Refseq representative genomes：以最小冗余度建立，包含了从NCBI Refseq基因组数据库中选择的参考和代表性基因组。可以判断序列的基因结构、基因组位置等，适用于序列类型为基因组DNA的情况；③Genomes for selected organisms (primary reference assembly only)：包含了来自主要染色体装配的完整或接近完整的基因组序列，...
②Refseq representative genomes:以最小冗余度建立,包含了从NCBI Refseq基因组数据库中选择的参考和代表性基因组。可以判断序列的基因结构、基因组位置等,适用于序列类型为基因组DNA的情况; ③Genomes for selected organisms (primary reference assembly only):包含了来自主要染色体装配的完整或接近完整的基因组序列,仅...
分别点击就可 以得到相应的序列页面.点击后如图所示,mRNA 序列: 蛋白序列如下: NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是 Reference assembly,它下面显 示的是 Genomic ,点击 Genomic 下面 Reference assembly 对应的 Genbank 或 FASTA 即可出 现编码的 DNA 序列(注意:只是编码序列,其中包括内含子,但一般...
3、RefSeq(Reference Sequence)序列接受号: (1)mRNA 记录(NM_*): e.g.:NM_000492 (2)基因组的DNA重叠群(NT_*): e.g.:NT_000347 (3)完整的基因组或染色体(NC_*): e.g.:NC_000907 (4)基因组的局部区域(NG_*): e.g.:NG_000019 页脚内容1 (5)从人类基因组注释、加工得到的序列模型(XM,XP,...
点击后如图所示, mRNA 序列:蛋白序列如下:NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是Reference assembly ,它下面显示的是 Genomic ,点击Genomic 下面 Referenceassembly 对应的 Genbank 或 FASTA即可出现编码的DNA序列 (注意:只是编码序列,其中包括内含子,但一般没有5非编码区) 。这一步就不做贴图演示了吧,...
NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是Reference assembly,它下面显 示的是Genomic ,点击Genomic 下面Reference assembly 对应的Genbank 或FASTA 即可出 现编码的DNA 序列(注意:只是编码序列,其中包括内含子,但一般没有5‘非编码区)。 这一步就不做贴图演示了吧,呵呵。