使用环境:知道序列对应的基因名称,可以考虑选择该Database进行序列比对 序列类型:cDNA 更新时间:2019/09/26 序列数量:33713514 3、 RefSeq Representative Genome Database Database描述:该数据库以最小冗余度建立,包含了从NCBI Refseq基因组数据库中选择的参考和代表性基因组,其结果是该数据库中的基因组是NCBI提供的...
Refseq mRNA：仅包含编码蛋白质的mRNA，适用于特定蛋白质编码序列的比对。Refseq RNA：包含编码蛋白质的mRNA和非编码RNA，适用于更广泛的RNA序列比对。Refseq representative genomes：与RefSeq Representative Genome Database相同，适用于基因组学比对。Genomes for selected organisms：包含特定物种的完整或接近完...
NCBI Genome links to the Nucleotide databaseChris Stubben
3. RefSeq Representative Genome Database：以最小冗余度建立，包含了NCBI Refseq基因组数据库中选择的参考和代表性基因组。适用于判断序列大概有几个外显子组成、某段序列在基因组中的位置、方向等。序列类型为基因组，最后更新时间为2015年9月30日，包含序列数量为13454918个。4. RefSeq Genome Datab...
3.Genome NCBI收录了超过1000种已经完成测序的生物体全部基因组序列和定位数据，及正在进行测序的物种阶段性发布的基因组信息。Genome涉及的物种涉及所有的生物领域：细菌、古细菌、真核生物，以及许多病毒、噬菌体、类病毒、质粒和含遗传物质的细胞器。如我们选择人类基因组（检索人类拉丁种名“Homo Sapiens＂或“Human＂...
HomoloGene的结果报告包括基因同源性和来自OMIM、小鼠基因组信息学(Mouse Genome Informatics, MGI)、斑马鱼信息网络(Zebrafish Information Network, ZFIN)、酵母基因组数据库(Saccharomyces Genome Database, SGD)、直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups,COG)和果蝇...
参见下面Genome和Maps部分,包括各种物种资源,人,小鼠,大鼠,酵母,线虫,疟原虫,细菌,病毒,viroids,质粒。 UniGene — 被整理成簇的EST和全长mRNA序列,每一个代表一种特定已知的或假设的人类基因,有定位图和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster形式在Unigene网页下载,完整的数据可以从FTP站点repository...
NCBI收录全世界所有实验室测序过的核酸信息,包括宏大的“人类基因组计划”测序结果、小鼠等所有物种的测序信息。此外,NCBI还提供许多功能强大的数据检索与分析工具(Analyze模块)。 2.NCBI数据库核酸序列检索、查看与下载 找到nucleotide(若是找基因或基因组可以选择gene,genome,此外...
比较基因组浏览器(CGV)(ncbi.nlm.nih.gov/genome) 允许用户基于两个基因组之间的比对进行视觉检查,自2023年初以来,已增加了超过200种物种和375个比对的数据,其中许多是哺乳动物间的跨物种例子。 除了国家生物技术信息中心(NCBI)生成的比对外,这些新数据还包括加州大学圣克鲁兹分校基因组研究所生成并在最小程度上由NC...
2.蛋白质序列数据库(Protein Sequence Database):在NCBI主页上,可以选择蛋白质序列数据库,输入蛋白质名称或蛋白质号,然后点击“Search”按钮即可查询蛋白质信息。 3.基因组数据库(Genome Database):在NCBI主页上,可以选择基因组数据库,输入基因组名称或基因组号,然后点击“Search”按钮即可查询基因组信息。 4.代谢通...