CD和CD-search是什么? CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
The Conserved Domain Database (CDD) is a freely available resource for the annotation of sequences with the locations of conserved protein domain footprints, as well as functional sites and motifs inferred from these footprints. It includes protein domain and protein family models curated in house ...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
NCBI保守结构域工具详解 在生信研究中，NCBI的CD（Conserved Domain）工具是挖掘蛋白质结构域信息的强大助手。这款工具设计简洁高效，能帮助研究者轻松揭示隐藏在蛋白质序列中的结构域秘密，从而深入理解蛋白质的功能和进化历程。结构域，作为蛋白质中的功能模块，是进化过程中保持相对稳定的区域。通过CD-...
先研究这个保守域(Conserved Domains),原来这个域(Domain)是蛋白质的功能及结构单元啊,在分子的进化(molecular evolution)中,这样的域可以被用来作为构造块(building blocks),这些块按照不同的序列排列会使得蛋白质呈现不同的功能。在分子进化中重现(recurring)的单元(units)被称为保守域(Conserved Domains)。那就可以...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。 出现如下界面,黄色部分即是本次要讲的工具。其中CD-search只能提交单条序列,Batch CD-Search可以上传多条序列。
Protein Cluster数据库提供存在一定联系的蛋白质集合信息，并与蛋白质注释、结构、结构域（如NCBI Conserved DomainDatabase，CDD）、家族相关数据库之间交互访问。Structure数据库是由蛋白质三维结构数据库PDB（the Protein Data Bank））衍生而来的大分子模建数据库，提供蛋白质三维结构信息及相关的可视化和结构比对工具。...
1. Conserved Domain Database (CDD):CD-Search基于NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含了已知的结构域数据库。 2. 结构域识别:用户可以提交蛋白质序列,CD-Search将对序列进行分析,识别其中的保守结构域。 3. 结构域注释:工具会提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其...
Conserved Domain Database (CDD) CDD是一种蛋白质注释资源,由一系列经过充分注释的古代结构域和全长蛋白质序列比对模型组成。 Database of Genomic Structural Variation (dbVar) dbVar数据库储存了大规模基因组变异相关的信息,包括大插入,缺失,易位和倒位。 除了分类突变之外,dbVar还存储已定义突变与表型信息的关联。