通过在蛋白质序列中识别这些保守结构域,可以更好地理解蛋白质的功能和进化。 CD和CD-search是什么? CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。
1. Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 2. 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 3. 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
在生信研究中，NCBI的CD（Conserved Domain）工具是挖掘蛋白质结构域信息的强大助手。这款工具设计简洁高效，能帮助研究者轻松揭示隐藏在蛋白质序列中的结构域秘密，从而深入理解蛋白质的功能和进化历程。结构域，作为蛋白质中的功能模块，是进化过程中保持相对稳定的区域。通过CD-Search对序列进行分析，研究者...
CD-Search是NCBI提供的一项服务,主要用于查找保守结构域。这个工具的核心功能包括: 1. Conserved Domain Database (CDD):CD-Search基于NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含了已知的结构域数据库。 2. 结构域识别:用户可以提交蛋白质序列,CD-Search将对序列进行分析,识别其中的保守结构域。
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。 出现如下界面,黄色部分即是本次要讲的工具。其中CD-search只能提交单条序列,Batch CD-Search可以上传多条序列。 2. 我们先以CD-Search为例,预测单条序列的结...
CD-Search与Conserved Domain Database(CDD)集成，为用户提供了一站式解决方案，能够快速、准确地在蛋白质序列中识别保守结构域。该工具通过分析提交的序列数据，自动识别其中的保守结构域，并以易于理解和解释的形式呈现结果。CD-Search的功能主要包括：数据库搜索：使用CDD中的结构域数据库对输入的蛋白质...
Conserved Domain Search Service (CD Search) 鉴定蛋白质序列中存在的保守结构域。 E-Utilities 在常规Web查询界面之外提供对NCBI Entrez系统内数据访问的工具。 Ebot 允许用户使用在线表单构建E-utility分析流程,然后生成Perl脚本以执行分析流程的工具。 Gene Expression Omnibus (GEO) BLAST 用于将查询序列(核苷酸或蛋白...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm./cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI...