Max Score（最高分）和Total Score（总分）：表示检索结果中命中序列的最高分和总分。分数越高，表示命中序列与查询序列（也称做Query）的亲缘关系就越近，当最高分和总分不同时，表示命中序列有多个不同的片段与查询序列相匹配。最高分表示命中序列中得分最高的片段。总分表示所有片段得分的总和。Query ...
NCBI进行BLAST检索时Query coverage的同源百分比和Max ident的百分比分别是什么意思,怎么得到的?如果得分一样时,哪个结果所占比重比较大? 相关知识点: 试题来源: 解析 Query coverage表示的是所比对序列与目标序列的覆盖度identity表示的是所比对序列与目标序列的相似度.不同的衡量标准,如果是看进化地位,建议建树后比较...
Query coverage表示的是所比对序列与目标序列的覆盖度 identity表示的是所比对序列与目标序列的相似度。不同的衡量标准，如果是看进化地位，建议建树后比较同源性。
(3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Total score总体分值 (5)Query coverage覆盖率 (6)E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。 E值越大,随机匹配的可能性也越大。 E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。 (7)Max ide nt匹配一致性,即匹配上的碱基数...
这里只演示blastx的使用方法。 刚才下载的nr库就是蛋白库,blastx就是用来将核酸序列比对到蛋白库上的。(nt就是核酸库) 因为我们下载的是已经建好索引的数据库,所以省去了makeblastdb的过程。 常见的命令有下面几个: -query <File_In> 要查询的核酸序列 ...
12、s下是对所比对序列的简单描述接下来是5个结果数值:(3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果(4)Total score总体分值(5)Query coverage覆盖率(6)E valueE(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。(7...
帮顶，同问。[ 发自小木虫客户端 ]
经NCBI Blast 比对后发现有三株菌的 Max score 相同 ；Total score相同 ；Query coverage 100% ； E...
NCBI中Blast序列比对小总结(求高人指点,如有纰漏请指出) NCBI中Blast可以用来进行序列比对、检验引物特异性 Blast导航主页面主体包括三部分 BLAST Assembled Genomes选择你要对比的物种,点击物种之后即可进入对比页面 Basic BLAST包含5个常用的Blast,每一个都附有简单介绍 Specialized BLAST是一些特殊目的的Blast,如Primer-...
(3)Maxscore匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Totalscore总体分值 (5)Querycoverage覆盖率 (6)Evalue——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。 E值越大,随机匹配的可能性也越大。 E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。