Expected threshold(期望值阈值): 期望值E是在一个数据库搜索中大于等于比对分数S的偶然发生的不同比对的个数。(比较重要的筛选指标) Word size(单词长度):默认为3,对BLASTP而言,大的单词长度会得到更精确的搜索结果。 Max matches in a query range(查询区域内的最大匹配数):有时在感兴趣区域内的匹配会被其...
Query Cover:表示咱们所查询的序列(query)与命中序列的匹配程度(也可理解为覆盖程度)。E value:是期望值或E值,表示当在一个特定大小的数据库中搜索时,我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值,如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索,我们期望还能找到1条与本...
在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 答案 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂相关推荐 1在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 反馈 收藏 ...
在NCBI的一个EST库中进行BLAST检索时,首先需要登录NCBI官网,进入BLAST工具。选择EST数据库作为检索对象,然后输入待检索的序列信息。输入完毕后,点击“BLAST”按钮,系统将自动开始检索过程。检索结果页面会显示BLAST的每条结果,每条结果都有一个E-value值。E-value值表示在没有同源序列的情况下,预期会...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 如何用ncbi设计引物以及验证引物 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗? 请问NCBI dna BLAST结果中Max score、Total...
二、NCBI BLAST比对搜索 (1) 访问BLAST 打开BLAST网页(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)...
NCBI BLAST比对结果详细分析(3) E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度 Identities 一致性,就是两个序列有多少是一样的 Query 代表输入序列 Subjct 代表数据库中的序列 结果详细说明 菜单与基本信息 NCBI Blast结果-菜单与基本信息...
如何看懂NCBI BLAST输出结果 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度...
如何看懂NCBI BLAST输出结果 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度...
E Value:相对的一个统计值,值越小,越可信, Length:输入序列的长度 Identities:一致性,就是两个序列有多少是一样的 Accession:登录号 NCBI网站: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 操作步骤 1、打开上述网址,出现图1页面,点击 ,进入图2页面 ...