Query Cover：表示咱们所查询的序列（query）与命中序列的匹配程度（也可理解为覆盖程度）。E value：是期望值或E值，表示当在一个特定大小的数据库中搜索时，我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值，如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索，我们期望还能找到1条与本...
Expected threshold(期望值阈值): 期望值E是在一个数据库搜索中大于等于比对分数S的偶然发生的不同比对的个数。(比较重要的筛选指标) Word size(单词长度):默认为3,对BLASTP而言,大的单词长度会得到更精确的搜索结果。 Max matches in a query range(查询区域内的最大匹配数):有时在感兴趣区域内的匹配会被其...
在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 答案 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂相关推荐 1在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 反馈 收藏 ...
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在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数；幂
E-value.表明在随机的情况下，其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。一般E值小于10-5时，表明两序列有较高的同源性。当E值小于10-6时，表明两序列的同源性非常高，几乎没有必要再做确认。E值2e-132应该可以认为接近于0.几乎...
E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度 Identities 一致性,就是两个序列有多少是一样的 Query 代表输入序列 Subjct 代表数据库中的序列 结果详细说明 菜单与基本信息 NCBI Blast结果-菜单与基本信息 1.下一步操作的菜单,你可以调整参数,重新比对、保存你的搜索条件以便下次比对、调整...
如何看懂NCBI BLAST输出结果 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度...
如何看懂NCBI BLAST输出结果 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度...
(3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Total score总体分值 (5)Query coverage覆盖率 (6)E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。 (7)Max ident——匹配一致性,即匹配上的碱基数...