干货|NCBI 引物设计 Primer-BLAST是NCBI中提供的引物设计工具,将BLAST与全局对准算法相结合,可以一步到位地设计特异性引物,并且可以验证已知引物的特异性,是科研人赖以生存的好伙伴。1.打开NCBI官网,选择BLAST 2.选择Primer-BLAST 3.Primer-BLAST 的输入 进入页面后,具体分为4个部分,分别为PCR Template、Primer...
Primer-BLAST可以直接从Blast主页(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)找到,或是直接用下面的链接进入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ 2. 输入引物序列信息 输入引物的序列(注意引物的方向) 3. 引物比对条件设置 (1)选择数据库(Database) 在specificity check区,选择设计引物或验证引物时的...
第四部分 如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性 提到序列比对,绝大多数战友都会想到 BLAST,但 BLAST 的使用确实又是一个很大的难题, 因为他的功能比较强悍, 里面涉及到的知识比较多, 而且比对结束后输出的结果参数 (指标)又很多。如果把 BLAST 的使用详细的都讲出来,我想我发帖发到明天也发不完,更何况我...
1.进入ncbi中的BLAST 2.下拉选择primer-BLAST primer-BLAST基本设置 产物大小min500 max700 太小不好,太大难p 提交 结果 设计引物 选择fasta模式 后面一样的 引物特异性检验 检验引物在基因组中是否能p出特异性片段 还是primer-BLAST 结果与设计引物时相同 主要应用在参考别人的引物,设计出来的放到其他基因组中是...
1.ncbi-blast 2.nucleotide BLAST 3.输入正向引物序列,物种选择(我的物种是斑马鱼,7955),选highly similar sequence 4.等待》》》 5.结果展示,如果排名第一的序列与你的基因相符,表明这个…
Primer-BLAST是NCBI中提供的引物设计工具,将BLAST与全局对准算法相结合,可以一步到位地设计特异性引物,并且可以验证已知引物的特异性,是科研牛马赖以生存的好伙伴。 1.打开NCBI官网,选择BLAST 2.选择Primer-BLAST 3.Primer-BLAST 的输入 进入页面后,具体分为4个部分,分别为PCR Template、Primer Parameters、Exon/intron...
2 在此网页下方处找到Primer-BLAST,点击进入 3 点击进入以下界面,在Primer Parameters里面输入自己已经设计好的引物序列,在此以病毒DNA序列为例子进行阐述,该引物为扩增EB病毒(人类疱疹病毒4型)DNA一段序列的引物。4 随后,在Primer Pair Specificity Checking Parameters里面的Databse中选择选项“Genome(chromosomes ...
干货| NCBI 引物设计 Primer-BLAST是NCBI中提供的引物设计工具,将BLAST与全局对准算法相结合,可以一步到位地设计特异性引物,并且可以验证已知引物的特异性,是科研人赖以生存的好伙伴。 1.打开NCBI官网,选择BLAST 2.选择Primer-BLAST 3.Primer-BLAST 的输入
如果这两种方法都不能找到你需要的引物的话,那就自己设计吧,建议使用Primer 5和Oligo。 4、如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性 提到序列比对,绝大多数战友都会想到BLAST,但BLAST的使用确实又是一个很大的难题,因为他的功能比较强悍,里...
"How To Create Real-Time PCR Primers Using Primer-BLAST" from YouTube, 视频播放量 2746、弹幕量 0、点赞数 86、投硬币枚数 12、收藏人数 258、转发人数 18, 视频作者 无非一梦, 作者简介 下辈子不学医.,相关视频:PCR Primer Design【PCR引物设计】,设计PCR引物(How