三、检索结果 点击BLAST运行,等待,,, 检索结果显示 检索结果解读(重点看5、8、9三个指标) Description:如果结果中出现过多hypothetical protein假设蛋白、Unnamed protein product未命名蛋白、Putative uncharacterized protein(未表征蛋白)等结果,表明进行比对的数据库不太合适,检索结果意义不大。 Scientific Name :学名 ...
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解 BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较(de)分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中(de)得分是对一种对相似性(de)统计说明. BLAST采用一种局部(de)算法获得两个序列中具有相似性(de)序列. Blast中常用...
总结: NCBI在线BLAST是一款功能强大的生物信息学工具,可以帮助研究人员进行序列比对和相似性分析。通过BLAST,我们可以获得详细的序列匹配信息,从而进行序列同源性分析、注释未知序列、鉴定基因和分析SNP等应用。熟练掌握NCBI在线BLAST的使用方法和结果解析,对于生物信息学研究具有重要意义。©...
使用NCBI在线BLAST可以分为四个主要步骤:选择BLAST程序,输入查询序列,选择目标数据库,解析和分析结果。 第一步:选择BLAST程序 NCBI提供了多种BLAST程序可供选择,包括BLASTN(DNA对DNA的比对)、BLASTP(蛋白质对蛋白质的比对)、BLASTX(DNA对蛋白质的比对)等。根据实际需求选择相应的BLAST程序。 第二步:输入查询序列 ...
BLASTX 是核酸序列到蛋白库中的一种查; BLASTN 是核酸序列到核酸库中的一种查询; TBLASTN 是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与 BLASTX 相反,它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 TBLASTX 是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译...
BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 Blast中常用的程序介绍: 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译...
【NCBI-BLAST】-- NCBI—Blast 工具介绍 I 用序列查基因 I 目标序列序列比对 I 比对结果分析 I 比对序列下载---时间较长,谨慎食用Alinandbb 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 3.1万 6 04:11 App 【知识分享】生物信息学 分子生物学必看 Blast序列比对使用教程 18.1万 85 08:01 App ...
结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLASTBLASTBLAST采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 111、、、是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一是蛋白序列到蛋白...
NCBI的在线BLAST:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 下面是具体操作方法 1,进入在线BLAST界面,可以选择blast特定的物种(如人,小鼠,水稻等),也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库作为例子。
NCBI BLAST使用教程及BLASTP比对结果分析BLAST，全称为Basic Local Alignment Search Tool，是NCBI提供的序列相似性搜索工具。它将用户提供的核酸或蛋白质序列与公开数据库进行匹配，找出相似序列，具有在线和单机版两种使用方式。针对特定需求，如批量处理或涉及隐私保护，推荐下载单机版。BLASTP检索步骤1.1 ...