1.2 BLAST 主页链接; 1.3“最新结果”链接;BLAST的搜索结果可以保存36h. 1.4“保存的策略”标签;列出了之前保存的一组搜索设置参数。它允许检查使用的搜索设置参数,快速重新启动这些搜索,以及下载用于在独立BLAST中共享或重复使用的特定策略。 1.5“帮助”选项;链接至BLAST ftp站点(ftp://ftp.ncbi.nlm./blast/或htt...
2.根据您的需求选择相应的工具,如“BLAST”进行序列比对分析。 3.进入选择的工具页面后,按照提示上传或输入您的序列数据。 4.设定参数并运行分析。 5.分析完成后,您可以查看比对结果、序列保守性等信息,并进行进一步的分析和解释。 五、订阅NCBI数据库更新信息 1.在NCBI主页上方菜单栏中选择“NCBI Account”。 2...
在设置参数时，注意最大结果数和E值的选择，E值是评估匹配可能性的重要指标。输入序列长度和数据库特性也需关注。Blast结果会显示匹配的序列数量、图形和详细比对信息，包括比对长度、一致性（Identities）、缺失或插入（Gaps）等指标。E值小于10-5通常认为结果可信，而MEGABLAST适用于同一物种的高相似度序列...
在BLAST按钮下面有一个“Algorithm parameters”,这是参数设置选项,一般用户 使用不到此项,所以它比较隐蔽,点击,原网页下方即可增加了Algorithm parameters的 内容。大部分战友都用不到更改这里面的选项,我也不多说了,有兴趣的朋友可以自己研究 一下。 3.依次填写上述网页必须部分,点击BLAST按钮后,出现如下界面(只截取...
BLAST是一种用于比对DNA、RNA或蛋白质序列的工具,可以找到与输入序列相似的序列。 使用方法: - 在搜索框中输入待比对的序列。 - 选择相应的数据库和参数设置。 - 点击搜索按钮,等待比对结果。 3.2 数据上传与下载 NCBI允许用户上传自己的数据,并提供了相应的工具和接口。同时,用户也可以从NCBI下载他人共享的数据。
先到： http://130.14.29.110/BLAST/index.shtml 选择 Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列，然后点 BLAST! 然后按 Format! 这时会弹出一个新的窗口，慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到...
例如，我手头的数据是大小不等的序列例如有的30nt，有的90nt等等，我希望批量跑了BLAST以后（与基因组...
步骤3：引物查找3. 使用UniSTS搜索STS数据库，根据目标基因和染色体位置筛选出包含引物序列的STS。点击链接查看预设的PCR片段长度和引物序列。步骤4：BLAST序列比对4. 在BLAST页面，选择Basic BLAST的nucleotide blast，输入序列进行比对。设置搜索集、精确度和参数后，点击比对，分析比对结果，注意理解评价指标...
Identities = 677/720 (94%), Gaps = 0/720 (0%)Strand=Plus/Minus 这是我BLAST的结果里的,各项...
生物信息技术应用,分子序列比对分析,Sequencealignment,Contents,序列比对的应用,序列数据库,基本类型:初级数据库收录存储序列的基本数据资源,如核酸蛋白质序列蛋白质空间结构及基因组信息。次级数据库在初级库资源基础上进