GI、GeneID和Accession之间的关系：GI号码与GeneID无直接关联。GeneID是针对每个基因的独特编号，一旦分配，便保持不变。而GI号码则会在序列发生变化时被赋予新的值。一个基因可能对应多个GI号码，甚至相同的蛋白质也可能对应多个GI号码。然而，GeneID通常是唯一的。GI号码和Accession版本号犹如序列的身
1.ACCESSION,形式为**_###,其中**为两个字母,其不同组合又可以区分为蛋白序列、核酸序列或基因组序列,而#为位数不等的数字;ACCESSION后面又会加版本号,以**_###.#形式表示,最后的尾数不同表示序列信息有所修改,数字越大版本越新。 2.GI,是GenBank Id的缩写,是序列的ID号,为唯一标识符。这是Genbank的...
格式说明:gi :”GenBank Identifier的缩写”, 是序列的ID号,标识符。唯一的。4557284 就是该序列的gi号ref :标示该序列是参考序列。NM_000646.1 该序列的Accession号和版本号 其他ncbi的id taxid:物种id,比如人是7505 snpid:rs开头,如rs12345 资料: 生信菜鸟团:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTE...
然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI或Accession号,也可以直接数据这些ID就可以查询,右方OPTIONS中选择要搜索的数据库,Expect Value等,或者使用默认设置,然后按...
2. 我们先以CD-Search为例,预测单条序列的结构域。 点击上图中的CD-Search,输入蛋白质/核酸查询序列,可以是FASTA格式的序列数据,或者输入GI或Accession号,同时在右方OPTIONS中选择要搜索的数据库,Expect Value等,或者使用默认设置,然后按“提交”按钮。
ACCESSION是NCBI序列数据中我们常用到编号(另一个是GI)。ACCESSION形式为CC_###,其中CC为两个字母,其不同组合又可以区分为蛋白序列、核酸序列或基因组序列,而#为位数不等的数字;ACCESSION后面又会加版本号,以CC_###.#形式表示,最后的尾数递增表示序列信息较之前的版本有所修改。这样ACCESSION+版本号就是一个唯一...
ACCESSION是NCBI序列数据中我们常用到编号(另一个是GI)。ACCESSION形式为CC_###, 其中 CC 为两个字母,其不同组合又可以区分为蛋白序列、核酸序列或基因组序列,而#为位数不等的数字;ACCESSION 后面又会加版本号,以 CC_###.#形式表示,最后的尾数递增表 示序列信息较之前的版本有所修改。这样ACCESSION+版本号...
两种类型的序列标识符(GI number、Accession.Version),有着不同的格式,并且开始使用的时间也不同。 1,GI?number(有时用小写字母"gi"),由一系列的数字组成,是NCBI在处理序列时连续分配的。跟序列的Accession number是没有关联。 在GenBank数据中,核苷酸序列的GI number放在Version的区域。 蛋白序列的GI number,如果...
ACCESSION是NCBI序列数据中我们常用到编号(另一个是GI)。ACCESSION形式为CC_###,其中CC 为两个字母,其不同组合又可以区分为蛋白序列、核酸序列或基因组序列,而#为位数不等的数字;ACCESSION 后面又会加版本号,以CC_###.#形式表示,最后的尾数递增表示序列信息较之前的版本有所修改。这样 ACCESSION...
Batch Entrez网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez 用这个工具,要求你有一个文件,里面是一个列表,可以是Accession Number,Gi Number,或是NCBI里其它数据库的各种标识符。文件的格式看例子:example.txt 使用过程: 准备包含accession numbers入库号 or Genbank号的ID(GenBank: MZ823386.1)文件 打开浏...