主要包括植物NBS-LRR抗病基因的克隆、结构、功能及其起源进化;进一步阐述了该基因家族在抗病基因 同源序列克隆、分子标记开发、基因定位等方面的应用,同时对植物NBS-LRR抗病基因家族研究中存在的 问题及未来研究方向进行了探讨。本文旨在为进一步开发和利用NBS-LRR抗病基因提供理论依据,为其他 ...
番茄NBS_LRR抗病基因家族全基因组分析
com谷子 NBS-LRR 类基因家族全基因组鉴定及表达分析李任建 1 ,申哲源 1 ,李旭凯 2 ,韩渊怀 1 ,张宝俊 1(1. 山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801; 2. 山西农业大学 生命科学院,山西 太谷 030801)摘要: 对谷子 NBS-LRR 类家族成员进行鉴定,并对其染色体分布、基因结构、保守基序、系统进化及表达水平进行...
稻瘟病是水稻生产上危害最严重的病害之一,针对该病的抗性基因在水稻中大多编码NBS-LRR类抗病蛋白质,该类蛋白质能够识别病原菌关联分子模式(Pathogen associated molecular pattern,PAMP),参与调控效应蛋白质激活免疫反应(Effector-triggered immunity,ETI)。NBS-LRR类蛋白质结构多样、功能复杂,它们在植物抗病过程中扮演了...
曲螺旋结构(Coiled—coil,CC),也称做CC-NBS—LRR类 型基因. 随着功能基因组的研究的迅速发展以及拟南芥全 第一作者简介:王岩,女,1979年出生,吉林辽源人,硕士,助教,主要从 事植物保护学方面研究.通信地址:130062吉林省长春市西安大路 5333 号,吉林大学和平校区植物科学学 院,Tel:0431—87835707,E—mail:wang197911...
番茄核苷酸结合位点(NBS)-亮氨酸富集重复(LRR)型抗病基因同源序列的分离与分析
1. NBS-LRR是最大的抗性基因家族之一 ; 2. 根据N端的Domains不同NBS-LRR分为两个亚族,含TIR的TIR-NBS-LRR(TNL)和含卷曲螺旋(CC)N端结构域的 CC-NBS-LRR(CNL)。 鉴定木薯NBS-LRR基因家族成员 利用从Pfam数据库下载的 raw NBS HMM 在木薯基因组数据中鉴定NBS基因,再用这些基因构建木薯特异的 HMM模型,然...
LRR抗病基因家族的研究进展,主要包括植物NBS-LRR抗病基因的克隆,结构,功能及其起源进化;进一步阐述了该基因家族在抗病基因同源序列克隆,分子标记开发,基因定位等方面的应用,同时对植物NBS-LRR抗病基因家族研究中存在的问题及未来研究方向进行了探讨.本文旨在为进一步开发和利用NBS-LRR抗病基因提供理论依据,为其他抗病基因的...
摘要: NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类, 具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序, 但尚未注释, 本研究对甘薯 基因组序列进行外显子预测, 得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列, 在此基础上进一步对NBS...
根据多数抗病基因(R)编码蛋白质的核苷酸结合区(nucleotide binding site, NBS)和富含亮氨酸重复(leucine-rich repeat, LRR)保守区域特点, 设计PCR特异扩增引物, 从水稻中克隆了大小约为520 bpDNA片段23个. 通过序列同源比较分析发现, 它们编码的蛋白质氨基酸序列包括有NBS-LRR类基因所具有的kinase-1a, kinase-2a, ...