nlr突变表现共分离,说明 rwt3 nlr候选基因与无毒基因 pwt3诱发的抗病性有关。 rwt4的候选 nlr基因附近包含一个小麦串联激酶基因( wtk ),该基因是抗白粉病基因 pm24的等位基因,因此作者将 wtk和 nlr基因均作为 rwt4的候选基因。采取...
除典型NLR蛋白外,植物体内还有许多缺少其中一个或多个结构域的非典型NLR蛋白,基因组分析显示拟南芥中共有约21个缺失C端LRR结构域的TN (TIR-NBS)类蛋白。近期研究发现TN1和TN2可以分别与典型TNL蛋白SOC3相互作用,监控拟南芥E3连接酶SAUL1的稳态(Liang et al., 2019)。还有研究报道拟南芥胞吐复合体成员exo70B1突变体...
NLR蛋白通常包括三个结构域，根据N端结构域的特异性，可分为TNL(TIR-NBS-LRR)和CNL(CC-NBS-LRR)两类。近年来，研究发现ETI免疫反应的激活需要RNL (CCR-NBS-LRR)家族成员，如NRG1和ADR1，作为助手。
植物中常与LRR结构域串联形成NLR免疫受体,哺乳动物则多与CARD、PYD等结构域组合参与炎症小体组装。这种结构域组合差异反映出进化压力下的功能特化,比如水稻抗稻瘟病蛋白Pikp的nbs结构域与重金属结合结构域融合,形成独特的重金属离子感应机制。这种结构创新为农作物抗病育种提供了新思路。 现有研究存在三个关键盲点。第...
根据NLR-Annotator论文,其中完整的NLR基因是由三部分组成的,所以TIR-NBARC-LRR或CC-NBARC-LRR的结构的是完整NLR基因。 Steuernagel B, Witek K, Krattinger SG, Ramirez-Gonzalez RH, Schoonbeek HJ, Yu G, Baggs E, Witek AI, Yadav I, Krasileva KV, Jones JDG, Uauy C, Keller B, Ridout CJ, Wul...
3.留下含有NLR motif的片段,片段与片段间的重合motif进行去重复整合;以片段中NB-ARC为起点去搜寻其上下游其他NLR结构域(如cc,LRR),搜索到后报告NLR位点 --- 由NLR-Annotator.jar完成 NLR-Annotator注释器原理图 doi:10.1104/pp.19.01273 三、NLR-Annotator运行注释拟南芥基因组的NLR loci 本文以Plant...
氨基酸序列与已知的水稻抗病基因(TO12、NR9、TR19、 NM9 和CR371)的NBS区域进行了系统发育树分析。 从系统发育树中可以看出4 个海南普通野生稻 NBS-LRR抗病基因片段可以分为2 类,其中NLRH2 和NLRH3聚为一类,NLRH1和NLRH4与其他水稻抗 病基因片段(TO12、TR19 和CR371)聚为一类,而4 个 海南普通野生稻NBS...
核苷酸结合-富含亮氨酸重复序列(NLR)蛋白通过识别病原效应物在植物天然免疫中发挥重要作用。TIR‐NBS(TN)蛋白属于非典型NLRs的一个亚型,但其在植物免疫中的作用尚不清楚。拟南芥(Arabidopsis thaliana,拟南芥)对丁香假单胞菌5(PSEUDOMONAS SYRINGAE 5,RPS5)的典型CC-NBS-LRR(CNL)蛋白抗性在识别了丁香假单胞菌III型效...
氨基酸序列与已知的水稻抗病基因(TO12、NR9、TR19、 NM9 和CR371)的NBS区域进行了系统发育树分析。 从系统发育树中可以看出4 个海南普通野生稻 NBS-LRR抗病基因片段可以分为2 类,其中NLRH2 和NLRH3聚为一类,NLRH1和NLRH4与其他水稻抗 病基因片段(TO12、TR19 和CR371)聚为一类,而4 个 海南普通野生稻NBS...