典型的NLR蛋白一般包括三个结构域,根据N端结构域的特异性NLR蛋白主要分为TNL(TIR-NBS-LRR)和CNL(CC-NBS-LRR)两类。近两年的研究还发现ETI免疫反应的激活需要两类N端特异的NLR蛋白RNL (CCR-NBS-LRR)作为助手(helper),包括NRG1 (N REQUIREMENT GENE 1)和ADR1 (ACTIVATED DISEASE RESISTANCE 1)家族(Dong et a...
对上述片段执行六框翻译,搜索翻译后获得蛋白的motif,根据搜索到的与NLR相关的motif的位置映射回20kb DNA片段上 --- NLR-Parser.jar 完成 3.留下含有NLR motif的片段,片段与片段间的重合motif进行去重复整合;以片段中NB-ARC为起点去搜寻其上下游其他NLR结构域(如cc,LRR),搜索到后报告NLR位点 --- 由NLR-Annotat...
根据NLR-Annotator论文,其中完整的NLR基因是由三部分组成的,所以TIR-NBARC-LRR或CC-NBARC-LRR的结构的是完整NLR基因。 Steuernagel B, Witek K, Krattinger SG, Ramirez-Gonzalez RH, Schoonbeek HJ, Yu G, Baggs E, Witek AI, Yadav I, Krasileva KV, Jones JDG, Uauy C, Keller B, Ridout CJ, Wul...
nlr基因和 wtk基因发生突变的突变系。对这些突变系接种 br48+ pwt4后,在 3个 wtk突变系中, 1个纯合突变与野生型相比变得更加感病,两个杂合突变系后代抗病性与 wtk基因突变表现共分离,而 10个 nlr基因突变系均表现抗病,与野生型没...
核苷酸结合-富含亮氨酸重复序列(NLR)蛋白通过识别病原效应物在植物天然免疫中发挥重要作用。TIR‐NBS(TN)蛋白属于非典型NLRs的一个亚型,但其在植物免疫中的作用尚不清楚。拟南芥(Arabidopsis thaliana,拟南芥)对丁香假单胞菌5(PSEUDOMONAS SYRINGAE 5,RPS5)的典型CC-NBS-LRR(CNL)蛋白抗性在识别了丁香假单胞菌III型效...
机译:核苷酸结合位点(NBS)和富含亮氨酸重复序列(LRR)受体(NLR)在植物免疫中起着重要作用。拟南芥基因组包含约150个编码NLR蛋白的基因,但很少有人对其进行研究。我们在烟草叶片中瞬时表达了一系列NBS-LRR蛋白,并发现CC-NBS-LRR蛋白(AT1G12290)能够触发细胞死亡,这是激活NLR蛋白的特征性功能。我们观察到YFP标记的AT...
目前已从植物中分离到近50个抗病基因,通过对其产物分析发现,这些抗病基因编码的产物存在极其相似的结构域,如核苷酸结合位点(nucleotidebindingsite,NBS)、富含亮氨酸重复序列(leucine-richrepeats,LRR)、丝氨酸/苏氨酸激酶(serine-threoninekinase,STK)、亮氨酸拉链结构(leucinezippers,LZ)、跨膜结构域(transmembranedomain,...
目前已从植物中分离到近50个抗病基因,通过对其产物分析发现,这些抗病基因编码的产物存在极其相似的结构域,如核苷酸结合位点(nucleotidebindingsite,NBS)、富含亮氨酸重复序列(leucine-richrepeats,LRR)、丝氨酸/苏氨酸激酶(serine-threoninekinase,STK)、亮氨酸拉链结构(leucinezippers,LZ)、跨膜结构域(transmembranedomain,...