根据NLR-Annotator论文,其中完整的NLR基因是由三部分组成的,所以TIR-NBARC-LRR或CC-NBARC-LRR的结构的是完整NLR基因。 Steuernagel B, Witek K, Krattinger SG, Ramirez-Gonzalez RH, Schoonbeek HJ, Yu G, Baggs E, Witek AI, Yadav I, Krasileva KV, Jones JDG, Uauy C, Keller B, Ridout CJ, Wul...
对上述片段执行六框翻译,搜索翻译后获得蛋白的motif,根据搜索到的与NLR相关的motif的位置映射回20kb DNA片段上 --- NLR-Parser.jar 完成 3.留下含有NLR motif的片段,片段与片段间的重合motif进行去重复整合;以片段中NB-ARC为起点去搜寻其上下游其他NLR结构域(如cc,LRR),搜索到后报告NLR位点 --- 由NLR-Annotat...
典型的NLR蛋白一般包括三个结构域,根据N端结构域的特异性NLR蛋白主要分为TNL(TIR-NBS-LRR)和CNL(CC-NBS-LRR)两类。近两年的研究还发现ETI免疫反应的激活需要两类N端特异的NLR蛋白RNL (CCR-NBS-LRR)作为助手(helper),包括NRG1 (N REQUIREMENT GENE 1)和ADR1 (ACTIVATED DISEASE RESISTANCE 1)家族(Dong et a...
nlr突变表现共分离,说明 rwt3 nlr候选基因与无毒基因 pwt3诱发的抗病性有关。 rwt4的候选 nlr基因附近包含一个小麦串联激酶基因( wtk ),该基因是抗白粉病基因 pm24的等位基因,因此作者将 wtk和 nlr基因均作为 rwt4的候选基因。采取...
拟南芥中共有约21个缺失C端LRR结构域的TN类蛋白。研究发现TN1和TN2可以分别与典型TNL蛋白SOC3相互作用，监控拟南芥E3连接酶SAUL1的稳态。此外，研究报道exo70B1突变体增强的抗病表型依赖于TN2，并且EXO70B1可以抑制TN2在烟草叶片中引起的细胞死亡。然而，TN2作为非典型NLR蛋白向下游传递信号，并且激活免疫...
三叶木通(Akebia trifoliata)是一种重要的多年生植物资源,由于其生长周期长,经常遭受各种病原菌的侵袭,其中白粉菌引起的白粉病是三叶木通主要病害之一,严重影响了其商业价值.植物基因组中最庞大的R基因家族是NBS抗性基因,它编码着含有核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸重复序列(LRR)的NLR蛋白,在植物抗病中发挥重要作用.为了...
核苷酸结合-富含亮氨酸重复序列(NLR)蛋白通过识别病原效应物在植物天然免疫中发挥重要作用。TIR‐NBS(TN)蛋白属于非典型NLRs的一个亚型,但其在植物免疫中的作用尚不清楚。拟南芥(Arabidopsis thaliana,拟南芥)对丁香假单胞菌5(PSEUDOMONAS SYRINGAE 5,RPS5)的典型CC-NBS-LRR(CNL)蛋白抗性在识别了丁香假单胞菌III型效...
目前已从植物中分离到近50个抗 病基因,通过对其产物分析发现,这些抗病基因编码的 产物存在极其相似的结构域,如核苷酸结合位点 (nucleotidebindingsite,NBS)、富含亮氨酸重复序列 (leucine-richrepeats,LRR)、丝氨酸/苏氨酸激酶 (serine-threoninekinase,STK)、亮氨酸拉链结构 (leucinezippers,LZ)、跨膜结构域(...
目前已从植物中分离到近50个抗 病基因,通过对其产物分析发现,这些抗病基因编码的 产物存在极其相似的结构域,如核苷酸结合位点 (nucleotidebindingsite,NBS)、富含亮氨酸重复序列 (leucine-richrepeats,LRR)、丝氨酸/苏氨酸激酶 (serine-threoninekinase,STK)、亮氨酸拉链结构 (leucinezippers,LZ)、跨膜结构域(...