然后使用TAG衍生的排序来驱动基因集富集分析(GSEA),在Hallmark基因集上进行,克隆复杂性的降低与Myc信号直接相关(Myc Targets V1和E2F靶点紧随Myc靶点V2,p < 10-5,图4B,C)。这个结果是非常有意义的,因为Myc信号传导是涉及细胞-细胞竞争的少数已描述的机制之一。Myc表达本身是超级竞争者克隆的特征,与Shannon熵显著负...
所有分布均针对使用 MYC_TARGETS_V1 基因集的 200 个样本的单个子集 为了说明使用 ES avg和 < ES avg > 对 ES 进行 25 次分裂作为更广泛基因集的测试统计量的好处,表 1比较了所有 50 个 Hallmarks 基因组的富集p值,这些值是使用 294 名患者使用三个统计数据计算得出的。ES avg和 < ES avg >的关联p值...
作者又将休眠细胞中显著下调的基因与MYC_TARGETS_V1和MYC_TARGETS_V2中的基因取交集,得到3个与MYC相关的显著下调基因Ccna2、Mad2L1和Plk1。 发现癌基因 Myc 在休眠肿瘤细胞中的表达略高于增殖肿瘤细胞,但 Wilcoxon 检验 p 值为 0.2,表明表达差异不大,这也说明 Myc 基因确实是一个重要的致癌基因,无论是休眠还是...
including 1,006 EA and 1,117 ES lncRNAs that showed epigenetic alteration in at least one cancer type (Table S2). The top 20 most frequently EA and ES lncRNAs are shown inFigure 2A. All the epigenetically regulated ...
apiVersion: v1 kind: ReplicationController metadata: name: nginx spec: replicas:3 selector: app: nginx template: metadata: name: nginx labels: app: nginx spec: containers: - name: nginx image: nginx ports: - containerPort:80 1.2、ReplicaSet ...