一、mRNA测序的原理 mRNA测序是在DNA测序技术的基础上发展起来的。其主要步骤包括RNA提取、RNA逆转录合成cDNA、文库构建、测序和数据分析等。 1. RNA提取 RNA提取是mRNA测序的第一步,其目的是从细胞或组织中提取出总RNA。总RNA包括mRNA、tRNA、rRNA等多种类型的RNA。为了选择性地富集mRNA,可以利用磁珠等方法将mRNA...
一、mRNA测序的原理 mRNA测序主要包括以下几个步骤:RNA提取、RNA逆转录、二代测序和数据分析。 1. RNA提取 需要从细胞或组织中提取总RNA。总RNA是包含了细胞内所有的RNA种类,其中包括mRNA、rRNA和tRNA等。提取RNA的方法有多种,常用的包括酚-氯仿法和商业化的RNA提取试剂盒。 2. RNA逆转录 提取到的总RNA中含有...
or RNA-Seq, is now a common method to analyze gene expression and to uncover novel RNA species. Aspects of RNA biogenesis and metabolism can be interrogated with specialized
CAGE-seq (Cap Analysis of Gene Expression AND deep Sequencing) 可以对mRNA中所有的TSS进行鉴定,这是通过加帽位点鉴定实现的(我更喜欢叫他“绿帽鉴定器”,咳咳)。 什么是加帽? 在细胞核内的转录中,mRNA需要经历多种加工和修饰,包括剪接,5'端的加帽和3'端的加尾,以及碱基上的化学修饰等,才能变为成熟的mRNA...
RNA-Seq. (a) Ligation of the 3′ preadenylated and 5′ adapters. “xxx” indicates barcode. (b) Labeling of the second strand with dUTP, followed by enzymatic degradation. (c) The Peregrine method involves template-switch attachment of the 3′ adapter. (d) BrAD-Seq captures ...