这种测序方法和DNase-seq原理类似,探测区域互补。MNase-seq使用的酶是限制性外切酶,将不受保护的区域统统切除,只余下核小体上缠绕的DNA序列。 该测序方法的特点: MNase-seq 同样被广泛应用到了很多物种中。 结合其他方法,MNase-seq可以探测和核小体相关的调控因子,比如ChIP-seq。 单细胞的MNase-seq还没有被开发出...
ATAC-Seq、ChIP-Seq、Dnase-Seq、MNase-Seq、FAIRE-Seq整体的分析思路一致,找到富集区域,对富集区域进行功能分析。 ChIP-Seq是揭示特定转录因子或蛋白复合物的结合区域,实际是研究DNA和蛋白质的相互作用,利用抗体将蛋白质和DNA一起富集,并对富集到的DNA进行测序。 DNase-Seq、ATAC-Seq、FAIRE-Seq都是用来研究开放染...