miRNA - TF - 基因关键调控网络:研究人员构建了关键调控网络,该网络可阐明关键因子对麻黄碱生物碱、黄酮类、单萜类等 SMs 生物合成的调控作用。不同关键调控基因在 ES 或 ER 中的表达偏好影响终产物积累,导致麻黄茎根代谢物组成差异巨大。 研究结论与讨论部分指出,该研究深入探讨了麻黄茎根差异代谢物的动态生物合...
接着,利用蛋白质‑蛋白质相互作用的数据库(STRING),将置信度设置为0.4,获得mRNA的调控关系对,并基于两个miRNA之间的共同靶点mRNA而得到miRNA‑miRNA的调控关系对,即两个miRNA之间至少有2个共同的靶点mRNA。通过合并miRNA‑mRNA、mRNA‑...
的miRNA-TF共调控网络进行研究.具体研究内容及结果如下:(1)通过对强光和醋酸钠胁迫初期的雨生红球藻进行小RNA高通量测序,总共获得9,363,208 clean tags,小RNA长度在21bp处出现峰值.总共鉴定出276个已知的miRNA,分别属于259个家族.此外,根据miRNA可能的前体预测并获得300个新的miRNA;(2)获得19个差异表达的miRNA,...
病例1:从TCGA BRCA miRNA/TF/非TF基因表达数据库中选择56个H19低表达组样本和56个正常样本。limma-voom R统计工具获得上调(UPR)和下调(DWR)的miRNAs/ tf /非tf基因列表(Table2)。 病例2:从TCGA BRCA miRNA/TF/非TF基因表达数据库中选择了40个H19高表达样本和正常样本。limma-voom工具鉴定上调和下调(Table2...
大家在做研究的时候也可以借鉴下面这篇文章它就完美的体现了上面提到的三大招作者首先筛选出来lncrnaheih再依次找到了与之相关的18个基因图中绿色的基因是与肿瘤生长和耐药性相关所以作者推测lncrnaheih也与肿瘤生长和耐药性相关 lncRNA,miRNA,TF的研究思路–GCBI学院 调控表达中相关的lncRNA,miRNA,TF应该如何去研究,...
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
TFmiR是一个整合分析TF、miRNA、target genes间互作的免费的web server,这三者都与疾病发病机制相关。细胞内在运作依赖于一个极其复杂的激活抑制系统的正确运作,其可能受许多方式的扰动。TFmiR有助于从网络的分子层面更好的阐述细胞机制。 TFmiR提供拓扑性质及功能的分析,使得其在生命科学领域中对研究者而言成为可信的系...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
调控网络基于pubmedmeshkegg等数据库将已经有文献报道数据挖掘以及数据库中的基因与基因mirnatflncrna的调控关系进行了整理组成了现有的调控网络 一键获取基因的TF,miRNA、lncRNA及上下游基因调控网络–GCBI学院 在做基因研究的时候,有时是不是苦于寻找其上下游调控基因,TF,miRNA等。数个数据库,N篇文献来回翻,才能辛...