miRNA自身的表达及单核苷酸突变等与癌症的易感性,以及癌症的发生、发展等过程有着密切的关系,根据miRNA在癌症发生过程中的不同作用,可将其分为如下几类: Oncomir通过调控下游基因表达,从而起到癌基因或抑癌基因的功能的miRNAMetastamir在促进或抑制肿瘤转移中发挥作用的miRNAApoptomir参与细胞凋亡过程的miRNAHypoxamir受...
miRNA是真核细胞中具有调控功能但不编码蛋白质的小分子(-2,-2+1)^2-(-1.25)^(-2)=0.016^2+⋯+50^2=(-1.25)^2+(-1.5)^2=(-3.14)*2^(控制的蛋白质(W蛋白)的合成,某真核细胞内形成该 miRNA及其发挥作用的过程示意图如下。 相关知识点: ...
结果: (1)3T3.L1前脂肪细胞分化成熟,诱导第10天油红O 染色可见呈圆形或椭圆形,细胞浆内大量红色脂滴聚集的分化成熟 的3T3.L1脂肪细胞; (2)N..
pre-miRNA:pri-miRNA在核酸酶Drosha和其辅助因子Pasha的作用下被处理成70个核苷酸组成的前体。 pre-miRNA结构特征图 mature miRNA:进一步经过DICER酶剪切,形成长度约为22个碱基的单链成熟miRNA。 上一篇讲了模式物种的miRNA分析流程,对于一些没有已知miRNA数据的物种该怎样鉴定和预测?下面就以东亚飞蝗为例,从SRA数据下...
下载后的数据处理方式和前面文章差不多。下载后的数据,我们打开单个文件看一下,比miRNA Expression Quantification数据多了2列。在miRNA_region列中就有是否成熟的信息。我们可以参考前面的文章【miRNA注释包:miRBaseVersions.db】进行转换为我们常用的名称,比如:hsa-let-7a-5p。
上期介绍了植物miRNA的鉴定标准, 通过这些标准就可以通过sRNA-Seq对植物的miRNA进行鉴定, 但自己通过写代码完成这个标准不仅费时费力,而且还会出现考虑不周的情况。本期介绍一款2019年发表在bioinformatics上的植物miRNA鉴定软件miRDP-2, 它不仅通过上期介绍的miRNA鉴定标准进行miRNA的鉴定,而且相比其它软件具有更快的运行速...
2型糖尿病(type 2 diabetes,T2D)是一种常见的糖尿病类型,其发病特征通常包括GSIS(葡萄糖刺激的胰岛素分泌)β细胞缺陷、糖耐异常、胰岛素抵抗以及高血糖。胰腺β细胞分泌胰岛素对血糖稳态维持至关重要,研究发现,胰腺β细胞功能障碍在T2D发病机制中起重要作用。MiR-21已被证明在葡萄糖不耐受患者和T2D小鼠胰岛中高表达,...
1.如此之多的RNA种类,miRNA在分类学上应该位于什么位置呢? RNA分类树状图 从分类树看miRNA位置是如此的一目了然! 2.只知道miRNA是非编码RNA,它来源哪里呢? A.基因间隔区(Intergenic):基因间隔区也就是编码基因的中间区域。 具有独立的和成簇两种类型,有单独的启动子启动。
miRNA在2型糖尿病胰腺中的表达 袁俐 任亚丽 徐文平 虞珏 孙明 丁颖 王宁 德伟 【摘要】目的 探讨糖尿病胰腺组织miRNA的表达变化。方法 链脲佐菌素(STZ)40mg/kg 腹腔注射+高脂高糖饲料喂饲健康雄性SD大鼠,成模(测血糖≥16.7rnmol/L)后4周,取胰腺组织 ...
miRNA是一类非编码RNA,具有调控基因表达的重要作用。Mirdeep2作为一款强大的生物信息学工具,能够定量分析已知的miRNA并识别新型miRNA,为研究者提供了便捷的解决方案。 一、Mirdeep2软件简介 Mirdeep2是一款基于深度学习的miRNA识别软件,通过对small RNA文库测序数据进行处理,能够准确地预测新型miRNA。该软件的核心算法采用...