我们知道,miRNA 可通过指导 RISC 在转录后水平下调基因的表达,从而实现 mRNA 的降解或翻译抑制。那么我们就先来说一说 miRNA 模拟物,作为一种合成的外源性双链寡核苷酸,其具有与内源性 miRNA 相同的序列。miRNA 模拟物主要有两种结合模式:模式1:通常情况下,miRNA 成熟后形成 miRISC 复合体,与靶基因 mRNA 的3 ...
该研究首次利用[Ru(bpy)3]2+/CNDs系统确定了乳腺癌相关生物标志物miRNA-21的特异序列。该研究团队详细描述了这种方法,并试图将该方法用于检测心力衰竭患者血清样本中的miRNA-21。 miRNA-21 miRNA-21存在于哺乳动物体内,是一种长约18-25个核苷酸的单链小分子RNA,可调控基因表达。阿尔茨海默病、心血管疾病和各种癌...
当miRNA被装载到RISC复合物中后，便可以发挥其基因表达调控的作用。miRNA会通过其种子序列（5 ’端第2-8位核苷酸）识别靶基因mRNA 3’UTR上的结合位点，携带RISC发挥作用。miRNA的作用效果主要有三种：转录抑制（transcriptional repression），mRNA的切割或降解（mRNA cleavage or degradation）。转录抑制涉及到一个重要...
汉恒生物所使用的萤光素酶报告基因载体psi-CHECK2采用了萤火虫/海肾双萤光素酶双报告基因系统,其中海肾萤光素酶为检测报告基因,而萤火虫萤光素酶则作为内参报告基因。验证miRNA与mRNA/lncRNA/circRNA的互作,将要研究的靶点序列(序列可以是mRNA的3’UTR,也可以是lncRNA/circRNA序列)插入到报告载体中,作为海肾双萤光素...
在成功构建完DNA运载体之后，根据miRNA-21的序列设计了相对应的SP（streptavidinprobe）探针，其中SP探针在5’端修饰了Biotin可以结合单体链霉亲和素。链霉亲和素是自然界中最稳定的蛋白质之一，Biotin作为一种生物小分子可与生物活性大分子结合，常被作为靶向标记物。链霉亲和素与Biotin的结合有很大的优越性，即使是在...
以hsa-mir-26a为例,可见上游引物设计只是将所有的U改为T而已,上游引物:5'-TTCAAGTAATCCAGGATAGGCT-3',成熟序列:5'-UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU-3'。再以hsa-mir-21为例,不仅改变T外,还在3'端删去了一个A,上游引物:5'-TAGCTTATCAGACTGATGTTG-3',成熟序列:5'-UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA-3'。
尽管Northern blotting能够检测成熟miRNA的大小,但它需要较多的起始材料,并且过程较为繁琐,限制了其在高通量研究中的应用[25]。微阵列技术能够同时监测数千个miRNA的表达,具有高通量的特点,但可能会受到同源miRNA序列间交叉杂交的影响,从而降低检测的特异性[26...
早期的生物信息学工具可以使用基因组中潜在的发夹二级RNA结构分析来预测新的miRNA。机器学习算法超越了序列和结构属性,允许计算机程序通过收集 来自先前确认的miRNA和一组阴性茎环的信息被认为不是miRNA前体(Chen等人,2018)。 MiRFinder是一种计算性的前miRNA预测工具,可以- ...
➤大多数miRNA通过与3′-UTR相互作用来调节靶mRNA的产生,但也存在与其他区域(包括基因启动子、5′-UTR或编码序列)的相互作用。不同类型的相互作用可能导致不同的结果,例如在特定条件下激活基因表达。 图1 miRNA生源示意图 ➤除了在细胞质中发挥作用...
该研究在活细胞中设计了一种自组装策略，用于细胞内miRNA的实时荧光和SERS双通道检测。其使用Mg依赖的8-17EDNA酶序列作为驱动马达，金纳米立方体(AuNCs)作为驱动组件，三分支双链DNA作为连接工具。策略选择腺嘌呤作为报告分子，简化了拉曼报告分子的标记过程。腺嘌呤稳定地分布在AuNCs的表面之间，面与面之间的广泛地热点...