如果之前的文献没有给出具体序列,只是写hsa-miR-21,那上mirbase数据库查hsa-miR-21,虽然他会列出hsa-miR-21-5p以及hsa-miR-21-3p两个不同的miRNA成熟体,但在下面有写Previous IDs,这样就能知道之前的hsa-miR-21是现在的5p还是3p(如上图所示),显然这里是指的hsa-miR-21-5p。
有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA，他们分别靶向不同的位点。这时候就要来进行区分了，一般以“-5p”和“-3p”分别命名，如hsa-miR-296-5p和hsa-miR-296-3p，分别表明从hsa-mir-296前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号，而表达水平较低的miRNA后面加上*...
miRNA的产生源于约70个碱基组成的单链RNA前体（pre-miRNA），通过Dicer酶的加工，形成长约20至24nt的成熟miRNA。这一过程中，有的pre-miRNA前体可能产生两条功能性的成熟miRNA，分别从5'端和3'端臂产生，分别标记为“-5p”和“-3p”。例如，hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p分别表示从hsa-mir-21...
这时候就要来进行区分了,一般以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p,分别表明从hsa-mir-21前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号,而表达水平较低的miRNA后面加上*号,如hsa-miR-21*,有时带“*”的miRNA就根本不出现。 而发夹状结构的miRNA前体...
这时候就要来进行区分了,一般以“-5p”和“-3p”分别命名,如hsa-miR-296-5p和hsa-miR-296-3p,分别表明从hsa-mir-296前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号,而表达水平较低的miRNA后面加上*号,有时带“*”的miRNA就根本不出现。但对于hsa-miR-296-3p和hsa-miR-296-...
MiR-128-3p in lung cancer tissues was also remarkably related to smoking and tumor size. The relative expression levels of miR-33a-5p and miR-128-3p were positively correlated in lung cancer tissues. Notably, miR-33a-5p and miR-128-3p in whole blood of lung cancer patients or early-...
运行方法:cmd进入终端,然后cd 文件夹名字,然后进入该文件夹,然后输入perl moveFile.pl将所有目录下的压缩包移动到一个文件夹中。 image.png 我们可看到多了个file文件夹 image.png 在这个文件夹中将所有文件解压到当前文件夹,删除压缩包,然后将merge.pl和meta文件拷贝到这个文件夹。
看到发表在19 July 2019的文章Strand-specific miR-28-3p and miR-28-5p have differential effects on nasopharyngeal cancer cells proliferation, apoptosis, migration and invasion,全文提供实验验证了miR-28-3p and miR-28-5p的生物学功能不一样。 但是我们作为数据分析人员,很难有这么复杂的背景知识,有时候仅仅...
了mi R-28-3p a n d mi R-28-5p的生物学功能不一样。但是我们作为数据分析人员，很难有这么复杂的背景知识，有时候仅仅是把表达矩阵给过滤，大家都懂的过滤操作。In s o me c a s e s,t w o ma t u r e mi R N As c a n b e e x c i s e d f r o m t h e s a me s ...
鉴定出了外泌体miR-30d-5p和let-7d-3p是宫颈癌及其癌前病变非侵袭性筛查有前景的诊断生物标志物。在临床上,抽血比TCT或巴氏涂片检查更加便捷,并且阴道或宫颈感染的风险更低。同时,它还可以纳入常规血液检测,这大大提高了临床的检验效率。此外,血浆外泌体中的miRNA是稳定的,对物理降解具有抵抗力,这是它们能够成为...