一、mirna测序readcount计算方法 1.1 什么是readcount? 在miRNA测序中,readcount指的是每个miRNA在测序数据中出现的次数。readcount的计算对于后续的差异表达分析非常重要,因此需要准确地计算每个miRNA的readcount。 1.2 readcount计算的原理 readcount的计算原理主要是通过将测序数据与miRNA参考序列进行比对,然后统计每个miRN...
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陈旧血痕miRNA高通量测序文库的构建方法(57)摘要本发明公开了陈旧血痕miRNA高通量测序文库的构建方法,包括陈旧血痕样品的预处理,miRNA的提取以及miRNA测序文库构建的步骤,其中文库构建包括:①miRNA 5’和3’接头的连接;②反转录;③PCR扩增;④PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,切胶回收145‑160bp大小的片段,即得测序文库...
miRNA-132通过Hedgehog信号通路对肝癌细胞凋亡的作用机制 目的:探究miRNA-132(miR-132)通过Hedgehog信号通路对肝细胞癌细胞凋亡的机制.方法:用miR-132类似物转染人肝癌HepG2细胞,将样本分为空白组(无转染HepG2),NC组(HepG2转... 康助习,匡黎,郭俊,... - 《解剖学杂志》 被引量: 0发表: 2021年 外泌体...
本发明公开了陈旧血痕miRNA高通量测序文库的构建方法,包括陈旧血痕样品的预处理,miRNA的提取以及miRNA测序文库构建的步骤,其中文库构建包括:①miRNA 5’和3’接头的连接;②反转录;③PCR扩增;④PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,切胶回收145‑160bp大小的片段,即得测序文库。采用本发明方法可实现在48小时内完成对陈旧血...
化学合成miRNA服务 体外转录服务 sgRNA/pegRNA设计及合成 基因合成 全基因合成 基因相关服务 质粒制备服务 一代测序服务 CE 测序 片段长度多态性CE检测 合规性一代测序服务 复杂序列测序 高通量测序 靶向捕获测序 表观遗传测序 单细胞测序 基因组测序 客户自备文库测序 扩增子测序 转录组测序 KBSeq全质粒测序服务 多...
【『珍藏版』NCB封面综述 | 探索无尽的#小RNA宇宙-新方向和新方法】 在过去20多年中,非编码小RNA(small non-coding RNAs (sncRNA))的研究不断地给学界带来惊喜。现有证据充分证明siRNA, miRNA, piRNA, 等经典sncRNA在基因转录后调控以及多种疾病发生过程中起着重要的作用。然而,随着测序技术和生物信息分析工具的...
本发明的目的是提供一种定量mirna的测序文库制备和分析方法。其步骤如下: (1)提供一种用于制备测序文库的rna样品,总体积为5μl,总量为2μg以上; (2)提供一种用于连接步骤(1)中所述的rna样品3’端的衔接子ra3,ra3的序列为5’-tggaattctcgggtgccaagg-3’; (3)提供一种用于连接步骤(1)中所述rna样品5’...
c、mirna测序文库的构建,步骤如下: c1、mirna5’和3’接头的连接; c,2、反转录; c3、pcr扩增; c4、pcr扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,切胶回收145-160bp(优选145bp左右)大小的片段,即得测序文库。 步骤a预处理的具体方法为:取5cm2陈旧血痕样品(约含有rna10ng-100ng),剪碎至3-5mm2,加入200-400μl(优选200...
该技术可以对高质量序列进行序列长度分布的统计及样品间公共序列统计,将筛选后的高质量序列分类注释,从而获得样品中包含的各组分及表达量信息,并对所有小RNA片段进行注释,对新的miRNA则进行靶基因预测。一、标准信息分析 数据产出统计,对原始测序数据去接头污染,去低质量reads;...