TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好。为了更加方便的进行miRNA的研究,针对人类中的miRNA, miRcode的开发者预测了miRNA与多种类型的RNA的相互作用,比如mRNA,lncRNA等,并将结果整理成了数据库,方便大家的使用与学习,网址如下 http://www.mircode.org/index.php 基于hg...
1.读取mircode的lncRNA数据 rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)mircode=read.delim("mircode_highconsfamilies.txt.gz",stringsAsFactors=F);dim(mircode) ## [1] 1329071 12 2.将lncRNA的数据挑选出来 colnames(mircode) ##[1]"gene_id""gene_symbol""gene_class"##[4]"microrna""seed_pos""...
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miRcode:⼈类miRNA结合图谱数据库TargetScan是⼀款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果⾮常好。为了更加⽅便的进⾏miRNA的研究,针对⼈类中的miRNA, miRcode的开发者预测了miRNA与多种类型的RNA的相互作⽤,⽐如mRNA, lncRNA等,并将结果整理成了数据库,⽅便⼤家的使...
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TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好。为了更加方便的进行miRNA的研究,针对人类中的miRNA, miRcode的开发者预测了miRNA与多种类型的RNA的相互作用,比如mRNA,lncRNA等,并将结果整理成了数据库,方便大家的使用与学习,网址如下 ...