提取的最终结果如下:02 操作步骤 第一步,因为mimic中的疾病数据是根据icd编码查找的,所以我们需要先找出“肺栓塞”对应的icd编码,从下表可以看出肺栓塞的icd编码大部分都是以“415“开头的 第二步,我们需要根据icd编码从诊断表diagnoses_icd中查出患了“肺栓塞“的患者的信息,并根据患者分组,此处小编已经把所...
以高血压性心脏病为例,在d_icd_diagnose表中找到符合高血压性心脏病的icd_code,并放work数据库下的d_icd_Hypertensive_heart_disease中 代码解释: SELECT d.*: 从表 d_icd_diagnoses 中选择所有列(*表示所有列) from mimiciv_hosp.d_icd_diagnoses d : 从名为 mimiciv_hosp 的数据库中的表 d_icd_diagn...
mimiciv数据库中患者的体重数据也存放在icu模块的chartevents表中,患者的体重数据有两种类型,分别是入院时测量的体重跟医院每天的测量体重。小编这里取的是患者两种体重的平均值。最终提取出来的“肺栓塞”患者的人口统计学信息如下,小编为了大家学习的连贯性,直接把人口统计学指标加在了原有的指标上面。
在获得数据集的访问权限并理解了数据结构后,接下来需要准备数据库工具并配置好环境。设置适合的数据查询和管理环境是进行数据提取的技术准备工作。 根据MIMIC-IV数据存储的数据库类型(例如PostgreSQL),安装相应的数据库管理系统。 确保所有必要的数据库驱动程序和库文件都已安装,并且建立了到MIMIC-IV数据库的连接。 四、...
二、提取进入ICU的基线检验数据(铁蛋白FER为例)很多同学反馈装好mimic数据库后,发现数据量太大,无从下手。对于初学者来说,这些数据完全用不上。我们只需要进入ICU的基线数据,就可以做出很好的临床研究了。如何拿到基线检验结果,帮大家集成了一段代码,轻松搞定 MIMIC-IV 数据库第一天检查的 最大值,最小值...
01 冠脉搭桥术后的患者有多少?比如我们有些同学在外科ICU, 想知道做过某种手术的患者有多少?比如心血管手术后的患者中冠脉搭桥术后的患者有多少?患者住院期间做的所有操作和手术都记录在procedure_icd表里面 首先我需要知道冠脉搭桥的icd编码都有哪些?因为是mimiciv数据库,表里面还混用了icd9 和 icd10,所以...
1、首先,你得要有MIMIC-IV数据库的访问权限 2、其次,连接上数据库: 使用数据库管理工具(如 ...
之前我们讲解了如何提取MIMIC-IV数据数据:MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的患者人口统计学指标 MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的实验室指标 这种直接SQL提取方式很直接,但是不是最好的方式也不利于数据的进一步统计分析、可视化和预测分析, 所以我们这里讲解下:如何用python语言连接我们装好的数据库,并做...
在这篇教程中,阿毅还是会基于上一篇的教程,教大家提取患者的生命体征指标。注:本次教程基于mimiciv数据库2.2版本 一,确定疾病的ICD编码 在后台工具中输入高血压的英文"hypertension",点击搜索之后,就会把MIMIC数据库这种疾病的ICD编码显示出来,同时也会列出数据库中该疾病的患者总入院次数,阿毅建议大家做科研分析...
我们在提取ICU的实验室指标如果要求是入ICU24小时内的,就是用这个来限制,只需改动y2即可(改成你临时表链接人口统计学信息表的表名),其他固定表达;结果:这里面的官方函数mimiciv_derived.DATETIME_SUB, mimiciv_derived.DATETIME_ADD 可以看我这两篇文章了解:MIMIC数据提取教程 - 官方提供的时间函数(一)