因此,测序并组装更高质量的Micro-Tom和M82基因组对于提高番茄育种效率和品质改良具有重要意义。 2024年6月17日,Journal of Genetics and Genomics在线发表华东师范大学生命科学学院姜伊娜教授团队题为“Near-completede novogenome assemblies of tomato (Solanum lycopersicum) determinate cultivars Micro-Tom and M82”的...
microtomtomato基因组番茄solanaceae RESEARCHARTICLEOpenAccessLarge-scaleanalysisoffull-lengthcDNAsfromthetomato(Solanumlycopersicum)cultivarMicro-Tom,areferencesystemfortheSolanaceaegenomicsKohAoki1*†,KentaroYano2†,AyakoSuzuki2,ShingoKawamura2,NozomuSakurai1,KunihiroSuda1,AtsushiKurabayashi1,TatsuyaSuzuki3,Tane...
Micro-Tom番茄矮化微型机制及其在植物功能基因组学研究中的应用
Micro-Tom番茄植株矮小,生长密度高,生命周期短,容易被高效转化,成为功能基因组 学研究的新型模式植物.文章对Micro-Tom的由来和生物学特征作了概述,重点阐述了Micro-Tom矮化微型的遗传机制以及该番茄在功能基因组学 研究中的应用和遗传转化体系研究的进展.关键...
该研究通过对测序得到的25个超长contig进行组装获得了仅含2个gap的Micro-Tom番茄基因组(Microtom_ECNU1.0),对27个contig进行组装获得了仅含13个gap的M82番茄基因组(M82_ECNU1.0)。同时,在多器官组织转录组学数据支持下,大幅提高了番茄中复杂结构域蛋白、组织特异性蛋白注释的准确性。例如对于植物特有的ABCG转运蛋白...