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就是整合分析,大概是借鉴了医学里的meta分析,将不同的GWAS整合到一起,可以是同一个trait,也可以是几个类似的trait,比如psychiatry底下的几种disorders。 Meta-analysis allows for custom analyses of individual studies to conveniently account for population substructure, the presence of related individuals, study-...
Dong等在针对中国汉族人群肺鳞癌的GWAS研究中发现了一个新的遗传位点(rs12296850),该位点可降低22.0%的肺癌发病风险(OR:0.78,95% CI:0.72~0.84)(GRADE:低)。Dai等通过对数据库进行跨种族全基因组Meta分析,结果显示,在非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌3个数据集中共鉴定出19个遗传易感位点,其中包括6个首次发现的易...
容易获取数据:GWAS、IEU等数据库容易获取。 MR与RCT差异 一般来说,在临床中,明确因果关系的金标准是随机对照试验(RCT)。然而,RCT费人、费时、费钱,某些情况下,由于实际或道德原因,许多风险因素不能随机分配。 在这种情况下,我们就可以采取孟德尔随机化,使用基因型来替代暴露因素进行因果关系推断。
Meta-analysis是什么?常用的工具有哪些? 就是整合分析,大概是借鉴了医学里的meta分析,将不同的GWAS整合到一起,可以是同一个trait,也可以是几个类似的trait,比如psychiatry底下的几种disorders。 Meta-analysis allows for custom analyses of individual studies to conveniently account for population substructure, the...
容易获取数据:GWAS、IEU等数据库容易获取。 MR与RCT差异 一般来说,在临床中,明确因果关系的金标准是随机对照试验(RCT)。然而,RCT费人、费时、费钱,某些情况下,由于实际或道德原因,许多风险因素不能随机分配。 在这种情况下,我们就可以采取孟德尔随机化,使用基因型来替代暴露因素进行因果关系推断。
具体步骤包括:(1)扩大GWAS一期研究样本量,以“千人基因组计划”数据为参考,对IgA肾病GWAS数据进行imputation分析,发现差异表达SNPs,并在大样本人群中进行验证,从而发现更多IgA肾病易感基因;(2)联合国外IgA肾病研究团队,获得数个独立种族人群IgA肾病GWAS数据,利用Meta分析方法,整合并对多个GWAS数据进一...