4、MeRIP-qPCR结果的计算 MeRIP-qPCR结果计算公式如下表: *其中DF和IF是稀释倍数。如最初用于IP和Input的RNA的比例为a:b,则在计算%(IP/Input)值时,需要乘以稀释倍数b/a(经过IP实验得到的RNA量一定少于不做IP实验的Input的RNA量,且逆转录+qPCR的使用的IP和Input的模板量也不同,因此要在计算的时候将差
性价比更高:包含RNA纯化磁珠,方便IP后RNA回收,无需另购RNA纯化试剂盒 多篇文章发表:已有多篇应用本试剂盒的m6A文章发表,见文末列表 实验流程 图1:GenSeq® m6A MeRIP试剂盒实验流程 结果展示 图2. MeRIP-qPCR检测结果:Input%分析 图3. MeRIP-qPCR检测结果:Fold Enrichment分析 图4. MeRIP-qPCR检测结果:信噪...
2. 试剂盒中的 Positive Primers 和 Negative Primers 是什么? Re:是根据文献选择的,靶向 HEK293 细胞中 m6A 修饰的某段 RNA 区域(Positive Primers) 和无 m6A 修饰的某段 RNA 区域(Negative Primers)的 PCR 引物.可用于 RT-qPCR 验证实 验效率和特异性.需要注意的是:m6A 修饰和 RNA 的表达,具有很强...
6、本试剂盒适配下游RT-qPCR以及特定甲基化的全转录组测序。 第一部分:背景简介RNA转录后修饰RNA修饰开始被认为仅仅是RNA在核酸结构上的化学微调,随着前沿研究技术的发展以及相关抗体的出现,当前发现RNA修饰在转录组水平广泛存在,并且是可逆的动态调控状态,参与生物进程的多方面,包括:细胞分化、性别决定、肿瘤的发生和转...
试剂盒产物可用于RT-qPCR检测,额外搭配NGS建库组分,经抗体捕获的RNA还可用于下游NGS测序。 检测周期短:全实验周期低于3h。 IEMed-K368使用实例如下: IP组DCBLD2相对表达水平显著高于IgG组,而GAPDH无明显差异,表明DCBLD2的富集是特异性的,以及DCBLD2发生了RNA甲基化修饰。 依据meRIP产物测序的数据分析结果,DCBLD2...
性价比更高:包含m5C MeRIP过程中的所有核心试剂,性价比高 实验流程 图1:GenSeq(R) m5C MeRIP试剂盒实验流程 结果展示 图2. 针对人工合成的含m5C(+)和不含m5C(-)RNA的MeRIP-qPCR检测结果。 图3. 针对m5C(+)RNA,分别用m5C抗体IgG对照抗体的MeRIP-qPCR检测结果。 已发表文献 附件下载:m5C试剂盒说明书产品...
图1:m6A MeRIP试剂盒实验流程 结果展示 图2. MeRIP-qPCR检测结果:Input%分析 图3. MeRIP-qPCR检测结果:Fold Enrichment分析 图4. MeRIP-qPCR检测结果:信噪比优于采用游离m6A洗脱的传统流程 图5. MeRIP-Seq结果展示:IGV可视化 图6. MeRIP-Seq结果展示:Motif分析 图7. MeRIP-Seq结果展示:m6A分布线图 图8. MeRI...
1. 按照下列组分配制RT反应液(反应液制备请在冰上进行)。为了保证反应液配制的准确性,减少分装造成的误差,应按照比实际用量稍大的体积配制反应液,最后加入RNA样品。 注意:注意反转录步骤RNA投入量按等体积进行,后续实验稀释及上机检测皆按比例进行。 2. 按如下程序进行反转录: ...
6、本试剂盒适配下游RT-qPCR以及特定甲基化的全转录组测序。 第一部分:背景简介 RNA转录后修饰 RNA修饰开始被认为仅仅是RNA在核酸结构上的化学微调,随着前沿研究技术的发展以及相关抗体的出现,当前发现RNA修饰在转录组水平广泛存在,并且是可逆的动态调控状态,参与生物进程的多方面,包括:细胞分化、性别决定、肿瘤的发生...
用超纯RNA提取试剂盒(DNaseⅠ)提取细胞RNA,Magna MeRIP^(TM)m^(6)A Kit试剂盒富集甲基化修饰片段,并通过RT-qPCR检测m^(6)A甲基化修饰的RNA区域;采用蛋白免疫印迹实验(Western blot)和逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术检测细胞中WTAP,KDM4B蛋白和mRNA的表达水平.采用克隆形成实验检测细胞体外克隆形成能力.结果:...