可以按照我专栏文章的教程一步一步进行构建分析。
先做alignment,再把alignment的结果存成mega文件，然后才能做进化树。直接用没有align过的序列建树会报错...
在mega里生成的进化树上可以编辑斜体
MEGA X做进化树时如何修改种名为斜体呢@天使托
pAup是权威性高些，更专业些，可以找到免费的破解版。 要是一般的sci期刊mega也是可以的。
本人已经完成用CLustalX软件比对完同源序列，生成.aln文件和.dnd文件，怎么进一步用MEGA软件做进化树？
把拟南芥和番茄的那一个clade定根（set root or rooted）。MEGA里展示系统发育树的界面会有类似功能，找...
把拟南芥和番茄的那一个clade定根（set root or rooted）。MEGA里展示系统发育树的界面会有类似功能，找...
下载新版MEGAX，打开之后选最下面那行里面的‘examples’，选那个chloroplast的。然后点上面的菜单里的...