选择主界面中的Phylogeny菜单,Bootstrap Test of Phylogeny — Neighbor-joining…Bootstrap选择1000次重复,模型选择核酸—p-distance。Compute后,得出系统结构树,如下:BY kousyouki
打开MEGA,将all_seq.fasta拖入MEGA主界面,选择Alignment – Align by ClustaIW.参数选择默认,点击OK,进行比对,此过程一般在2分钟以内。一般来说,我们下载的fasta文件的基因命名比较复杂,可能包含基因组ID,物种名,地点等信息。为了复现文章中的效果,我们需要将序列名进行更名。更名方法如下,双击第...
可以按照我专栏文章的教程一步一步进行构建分析。
先做alignment,再把alignment的结果存成mega文件,然后才能做进化树。直接用没有align过的序列建树会报错...
求助,MEGA软件做..经过反复研究,发现在建树参数选择时,一定要选择红色方框中的“Bootstrap method”,数值我是按照核苷酸序列一样修改为“1000”,如下图。最后建好的树分支上有数值,一般50以下不要显示。
或者说怎么用Mega做多个菌的多个基因序列的进化树?或者怎么处理MLST测序的结果再做进化树?发自小木虫IOS...
本人已经完成用CLustalX软件比对完同源序列,生成.aln文件和.dnd文件,怎么进一步用MEGA软件做进化树?
有偿解决进化树问题.私聊 来自iPhone客户端2楼2021-06-24 11:32 回复 贴吧用户_54GUWe6 童生 2 数据太大了,建议用服务器做 3楼2021-07-22 15:55 回复 大树爱阴天 白丁 1 有的序列的两两距离太远了,可以先计算两辆距离看哪些太远的,单独拎出来研究研究。 4楼2021-12-30 09:06 回复 ...
做系统进化树请问析物进化指切命形态发、发展演变程进化词源于拉丁文evolution原义展般用指事物逐渐变化、发展由种状态渡另种状态1762瑞士者邦尼特先词应用于物简介物进化指切命形态发、发展演变程物进化树进化词源于拉丁文evolution原义展般用指事物逐渐变化、发展由种状态渡另种状态先词应用于物邦尼特物进化基本单...
回答:我也不会,但我支持你,请你把分给我!!