Mega X 驱动 驱动 Mega X驱动软件_Windows版本 欢迎下载Mega X驱动软件_Windows版本 Mega X驱动软件_Mac版本 欢迎下载Mega X驱动软件_Mac版本
全新切片软件 质保政策 Photon Mono M5系列 上色套装 Photon Mono M7系列 Kobra 3 系列 Photon Mono 系列 Photon 系列 Kossel Vyper Photon DLP系列 Anycubic 3D Scanner 扫描仪 Photon M3系列 4Max Metal系列 Kobra 系列 4Max Pro 系列 Wash&cure Mega 系列 Predator Mega X 切片软...
MEGA毫无疑问是目前科研人员使用最多、体验最好的进化树构建软件。 新版的MEGAX主要特点是大数据运算能力的增强,并支持多种计算平台,如下图。大家可以到MEGA的官网(https://www.megasoftware.net/)下载MEGAX(下载速度可能有点慢),为了方便大家下载,OmicShare论坛也提供Windows系统的安装包(图形界面版),点阅读原文查看...
这里可以选择从文件中提取sequence, 文件类型可以是fasta,nexus,mas等等。 Mega X常用alignment工具包括ClustalW和MUSCLE。ClustalW实现了迭代算法,因此在较早的步骤中不太可能纠正错误,相对于MUSCLE效果好但分析时间长;而MUSCLE则采用了一种渐进式算法,可以在整个过程中对列进行重新优化,速度很快。如果希望用一种较快的...
今天我们就来介绍一下MEGAX在图形界面(GUI)下如何构建系统发育树。系统发育树又称演化树或者进化树,是一种呈现不同物种或者是同物种不同族群的个体之间的亲缘关系树状图,可应用于亲缘分支分类方法、流行病学以及生态学等等[1]。 第一步:下载MEGA软件
从软件界面的风格来看,MEGA X与MEGA7还是有较大的差异的,如下图。 MEGA X 的主界面 MEGA 7 的主界面 下面就用自带的示例文件,体验下使用新版的MEGA构建进化树。首先,点Data按钮,导入示例文件(Unaligned HSP20 sequence datafor four species),文件为fasta格式,如下图,整个过程与MEGA7区别不大。
megaX这个软件用于建系统树着实方便,参见这篇好教程: 放电的毛衣:MEGA在分子进化树方面的应用但是,之前在对序列进行alignment处理后,我都是手动删除所有有gaps的列,在alignment的界面一直没找到自动删除所有…
工具/原料 MegaX rdp网站的序列文件 方法/步骤 1 首先打开mega软件，页面是这样，不同版本页面不同，但是功能是基本差不多的。2 点击file，opena file，选择刚才你保存的那篇，然后选择align，然后就会弹出来序列来。3 接下来插入我们要看的样品的序列，可以直接用图中的那个insert……图标打开，然后就导入了我们...
但是考虑到现在各个毕业学生用的MEGA软件都是MEGAX了,所以接下来我就以MEGAX为例(https://www.megasoftware.net/下载地址)。提示一下,这一步的操作直接用2.1这小节提供的txt文档(这就是你建树的原始文件)即可。 Step1:序列比对 进入界面依次点击 Align Edit/Build Alignment...
今天主要介绍的是在MEGA-X图形界面下构建系统发育树并且对发育树进行美化。下载安装好MEGA-X后,首先打开软件。 此处我们以一株细菌的16S rRNA序列为目标序列,首先在NCBI中进行Blast比对,下载将要一起比对建树的菌株序列。在NCBI中输入序列或者上传文件,选择数据库时可以选择「Nucleotide collection(nr/nt)」或者「16S ...